湖州肛肠科医院排名靠前的是湖州市中心医院肛肠外科、湖州市第一人民医院肛肠科、湖州市南浔区人民医院肛肠外科等。湖州市中心医院肛肠外科年结直肠肿瘤手术近300例，占湖州市地区三分之二左右，腔镜率90%以上，整体综合医疗服务能力达到省内同行领先水平。湖州市第一人民医院肛肠科是湖州市重点学科，在腹腔镜手术、痔疮微创手术等方面居于省市领先水平，在浙北地区有较高的影响力。湖州市南浔区人民医院肛肠外科是区级重点专科，也是浙江省人民医院重点帮扶专科，可诊治多种肛肠相关疾病。
1、湖州市中心医院 肛肠外科
该科室可熟练开展结直肠肿瘤的微创及传统手术，同时具备各种肛周疾病、慢性便秘等病症的诊治能力。目前科室年手术量约700台，其中年结直肠肿瘤手术量近300例，占湖州市地区同类手术量的三分之二左右，结直肠肿瘤手术腔镜率达90%以上，技术水平达到省级水平，整体综合医疗服务能力处于省内同行领先水平。
2、湖州市第一人民医院 肛肠科
该科室始建于2014年，是湖州市重点学科，擅长恶性肿瘤综合性治疗、胃肠道腹腔镜微创手术，可开展腹腔镜结直肠癌根治术、腹腔镜低位直肠癌保肛手术、吻合器痔上粘膜环切术及各类胃肠道肿瘤根治术，在腹腔镜手术、痔疮微创手术等方面居于省市领先水平，在浙北地区有较高影响力。近3年科室发表论文10余篇，其中SCI论文5篇；科研立项10余项，其中省部级课题3项；获发明专利10项；举办多项国家级、省级继教班。
3、湖州市南浔区人民医院 肛肠外科
该科室是医院普外科的特色专科之一，为区级重点专科，同时是浙江省人民医院重点帮扶专科。科室主要诊治的疾病范畴涵盖便秘、肛裂、肛周脓肿、肛瘘、肛乳头肥大、肛乳头瘤、脱肛（直肠脱垂）、混合痔、内痔、外痔、肛门狭窄、肛门瘙痒症、肛周湿疹、炎性肠病、大肠肿瘤等肛肠相关疾病。
4、湖州市双林人民医院 普外科
该科室由一批临床经验丰富的主治医师以上职称的医务人员组成，熟悉普外科常见病、多发病、疑难病的诊治，尤其在治疗脂肪瘤、痔疮、乳腺结节、外痔、混合痔、疝气、腹股沟斜疝、腹内疝、切口疝、阑尾炎、化脓性阑尾炎、肛周脓肿、肛裂、肛瘘等方面具有显著优势。
5、湖州市南浔区菱湖人民医院 普外科
该科室是医院最大的临床学科之一，下设胃肠、肝胆、脾脏、甲状腺、乳腺、肛肠痔瘘外科等分支专业，上述领域的各类疾病及各器官良、恶性肿瘤均属于科室诊治范围。科室现有副主任医师1人、主治医师4人、住院医师3人，在区内率先成立腹腔镜治疗中心，年收治各类病人2700人次，施行各类手术1000余例，拥有丰富的内镜检查和治疗经验。科室依托资源下沉与湖州市第一人民医院普外科建立协作关系，该院相关专家每周五定期到科指导手术及教学查房，可开展痔疮、肛瘘、外科急腹症等多种外科常见病的治疗。
