重庆男科中医院比较好的有重庆市中医院、重庆医科大学附属第一医院、陆军军医大学新桥医院等，重庆市中医院采取中西医结合治疗手段治疗男科疾病；重庆医科大学附属第一医院的中西医结合科/中医科为临床重点学科；陆军军医大学新桥医院的中医科，为重庆市卫生局重点中西医结合建设专科单位，这些医院都对男科疾病有着丰富诊疗经验。
第一名：重庆市中医院
重庆市中医院不断拓展男科疾病的中西医结合治疗手段，中药汤剂、丁桂贴、电针、耳穴压豆、艾箱盒灸、中药直肠导入、阴囊外敷中药、中药药物浸浴等中医特色治疗，并先后总结出10余个科室验方，其中清淋合剂系我科独立研制的院内制剂，其对泌尿生殖道感染具有独特的临床疗效。目前我科采取中西医结合治疗手段在前列腺疾病、勃起功能障碍、早泄、男性不育等疾病上取得了满意的临床疗效。
第二名：重庆医科大学附属第一医院-中西医结合科/中医科
重庆医科大学附属第一医院的中西医结合科/中医科，现为国家中医药管理局中西医结合临床重点学科、国家中医药管理局老年病重点专科。诊疗过程中强调中西医并重、取长补短、优势互补；突出药物外治法及针灸理疗等中医特色疗法；主要诊治内科疾病及其他疑难病症，对于男科疾病有着丰富的诊疗经验。
第三名：陆军军医大学新桥医院-中医科
陆军军医大学新桥医院的中医科，为重庆市卫生局重点中西医结合建设专科单位。辨证施治对患者运用中西医结合在各种慢性疾病、男性疾病、神经系统疾病等取得满意疗效。率先在重庆地区开展治未病研究，进行重庆地区人群体质调查，结合中医“天人相应”理论，在呼吸、风湿、消化、妇科及内分泌疾病等方面开发出根据气候特点及患者体质的穴位调敷治疗。
第四名：重庆大坪医院-中医科
重庆大坪医院的中医科，现为集临床、教学、科研为一体的综合性科室，主要以门诊及中医针灸治疗室为主，并协助院内各科室的中医会诊，近年来在月经不调、不孕症、更年期综合征、肿瘤、慢性肝病、慢性结肠炎、脾胃病、老年病、中风、面瘫、颈椎病、腰椎病、男科疾病的治疗方面形成较明显的特色和优势。
第五名：重庆市公共卫生医疗救治中心-中医科
重庆市公共卫生医疗救治中心的中医科，开展各种针刺艾灸、推拿、火罐、穴位埋线、穴位注射、中药外敷等常规理疗技术。广涉各科病症（如肿瘤、高血压及相关疾病、慢性咳嗽及呼吸系统疾病、慢性胃炎及消化系统疾病、女性月经及妇科疾病、男科疾病等），疗效显著。
第六名：重庆市第九人民医院-中西医结合科
重庆市第九人民医院的中西医结合科，坚运用口服中药汤剂、丸剂、粉剂，以及三伏灸、三九灸、穴位贴敷、耳穴压丸、药物离子导入、药物熏蒸、中医定向透药、针灸、拔罐、刮痧、足浴等中医技术，个体化治疗慢性支气管炎、支气管哮喘、胃炎、高血压、糖尿病、脑梗塞、男科疾病等常见的内科疾病，治疗经验丰富，效果显著。
第七名：重庆市南川区人民医院-中医科
重庆市南川区人民医院的中医科，为全国综合医院中医药工作示范单位、重庆市重点专科，可治疗面瘫、血管性头痛、脑供血不足引起的眩晕、颈椎病、肩周炎、腰椎间盘突出症、骨质增生、软组织损伤、骨性关节炎、失眠、肥胖、痤疮、带状疱疹、男科疾病等。运用传统针灸疗法如：针刺、放血、拔罐、刮痧、中药熏蒸、中药封包治疗等治疗颈腰肢疼痛。
第八名：云阳县中医院
云阳县中医院为国家三级甲等中医院，是全县中医药医疗、教学、科研、预防、保健、培训中心。分设内、外、骨、妇、儿、泌尿、五官等临床医疗医技科室，对外、骨、妇、心管内、儿科等危急重症有较高的诊治水平和抢救实力。此外，对于男科疾病也有着丰富的诊疗经验。
