南京内分泌科医院排名比较靠前的是南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院。
南京医科大学第一附属医院内分泌科是全国老牌重点专科，亚专科齐全，技术平台领先，科研经费充足。南京鼓楼医院内分泌科是国家代谢性疾病临床医学研究中心分中心，干细胞治疗1型糖尿病等技术国内领先，学术影响力突出。东南大学附属中大医院内分泌科是江苏省临床重点专科，糖尿病足病诊治与甲状腺消融技术省内领先，科研实力强劲。
1.南京医科大学第一附属医院 内分泌科
南京医科大学第一附属医院内分泌科是全国最早的内分泌代谢病诊疗基地之一，为国家临床重点专科、江苏省内分泌代谢病重点学科，同时是省内分泌代谢病医疗质控中心。科室亚专科配置完善，开设1型糖尿病、妊娠相关内分泌疾病等特色专病门诊，拥有标准化胰岛免疫诊断、胰岛细胞移植等9项特色技术平台。科研力量雄厚，近三年承担多项国家级重大课题与国家自然科学基金，总经费超3500万元，在糖尿病、甲状腺疾病等领域诊疗水平位居国内前列。
2.南京鼓楼医院 内分泌科
南京鼓楼医院内分泌科是国家临床重点专科、国家代谢性疾病临床医学研究中心分中心，入选复旦榜年度最佳专科排行榜，综合实力位居江苏前列。学科带头人朱大龙教授学术地位显赫，担任中华医学会糖尿病学分会主任委员。科室在1型糖尿病干细胞治疗、糖尿病神经并发症筛查、肥胖减重代谢手术等领域国内领先，获国家科学技术进步二等奖等多项重磅奖项，牵头制定21项行业指南，科研与临床诊疗双优。
3.东南大学附属中大医院 内分泌科
东南大学附属中大医院内分泌科是江苏省临床重点专科、博士学位授予点，科研实力突出，以第一及通讯作者发表SCI论文180余篇，总影响因子超600分。科室特色鲜明，建成江苏省首家多学科合作的糖尿病足病诊疗中心，一体化筛查与诊治模式居国内领先，甲状腺结节细针穿刺与消融术年开展量达600余例。主持多项国家重点研发计划与国家自然科学基金，获多项省级科技奖项，综合诊疗水平省内领先。
4.东部战区总医院 内分泌科
东部战区总医院内分泌科是南京军区内分泌中心、南京市医学重点专科，学科底蕴深厚，能诊治各类疑难复杂内分泌代谢病。科室配备动态血糖监测仪、胰岛素泵等先进设备，开展无线实时动态血糖监测联合胰岛素输注等特色技术，在糖尿病肾病早期诊治、甲状腺眼病多靶点免疫治疗、垂体及肾上腺疾病诊疗方面优势显著。科研成果丰硕，主持多项国家自然科学基金与省部级课题，获20余项省部级以上科技进步奖，临床救治能力强劲。
5.南京市第一医院 内分泌科
南京市第一医院内分泌科是南京市及江苏省临床重点专科，为南京医科大学硕博培养点、国家级博士后科研工作站，也是全国较早的内分泌专科之一。科室团队硕博学历占比90%，骨干多人赴海外深造，学科带头人马建华教授学术影响力突出。在糖尿病强化治疗领域全国领先，新诊断糖尿病患者临床缓解率高，开展葡萄糖钳夹技术、全院血糖管理等特色项目，科研基金充足，发表多篇高影响因子SCI论文，综合诊疗水平位居区域前列。
