镇江小儿消化科医院排名靠前的是江苏大学附属医院儿科、镇江市第一人民医院儿童内科、镇江市妇幼保健院消化内科等，江苏大学附属医院儿科设有消化专科，配备小儿纤维支气管镜等多种先进诊疗设备，年门急诊人次达15万余人；镇江市第一人民医院儿童内科在小儿消化系统疾病诊治方面经验丰富，开展小儿内窥镜的检查和治疗新技术；镇江市妇幼保健院消化内科可开展儿童胃肠镜诊治，掌握内镜下多种微创诊疗技术。
1、江苏大学附属医院 儿科
该科室2000年成为镇江市临床重点专科，2015年成为江苏省临床重点专科，2018年成为江苏省新生儿危急重症救治中心，2021年新生儿医学被确认为省妇幼健康重点学科，年门急诊人次达15万余人。科室设置消化亚专科，专门处理儿童腹痛、腹泻等小儿消化相关病症，配备小儿纤维支气管镜等先进设备。近五年以第一申报人获国家自然科学基金2项、江苏省自然基金等省级课题6项，以第一申报单位获江苏省临床新技术引进二等奖三项。2019年母婴楼投入使用，进一步优化小儿消化疾病患儿就诊与住院环境。
2、镇江市第一人民医院 儿童内科
该科室前身由张志清先生于1958年创建，年门诊量达13万余人次、年收治住院病人4000余人次。科室设立小儿消化专科，在小儿消化系统疾病诊治方面经验丰富，开展小儿内窥镜的检查和治疗，这项技术填补了镇江市内空白。科室建立起多系统儿科亚专业体系，可对儿童各类消化道疾病开展规范化诊疗，同时承担南京医科大学、江苏大学医学院等院校的教学实习工作，持续开展小儿消化相关临床技术研究，在省内儿科领域拥有一定影响力。
3、镇江市妇幼保健院 消化内科
该科室成立于1994年，为独立临床专科，能够开展儿童胃肠镜诊治，拥有经鼻胃镜、电子胃、肠镜及各类内镜配套治疗设备。科室可完成无痛胃肠镜、内镜下息肉摘除术、内镜下止血、粘膜切除术等操作，适配儿童消化道异物、肠道息肉、肠道早癌等小儿消化相关病症的微创诊疗。科室具备消化系统危急重症、急性中毒的综合处置能力，依托内镜技术优势，为镇江地区儿童消化道疾病提供检查与内镜下治疗一体化服务。
4、丹阳市人民医院 儿科
该科室始建于1980年，每年门诊量达50000余人次，年收治住院病人4000余人次。科室擅长处理小儿急慢性腹泻这类小儿消化常见病症，承担丹阳地区儿科疑难杂症与危重患儿的救治任务。科室长期和复旦大学附属儿科医院、南京市儿童医院等机构保持技术交流，学科带头人李业瑜曾在复旦大学附属儿科医院、南京儿童医院进修，可对儿童各类消化道不适开展规范诊疗，同时开设儿科专家门诊，方便消化疾病患儿定期复诊。
5、丹阳市第二人民医院 儿内科
该科室为镇江市级临床重点专科，搭建多学科特色亚专科体系，长期与上海复旦大学儿科医院、南京市儿童医院等单位开展疑难病例会诊合作。科室重点建设新生儿方向，配备新生儿重症转运系统、呼吸机等设备，能够救治危重患儿，同步处理新生儿阶段消化道相关急症。科室成功救治极低、超低出生体重儿等危重病例，在新生儿坏死性小肠结肠炎这类新生儿消化危重症的救治方面积累临床经验，为丹阳区域儿童消化急症提供救治保障。
