广西壮族自治区脑科医院擅长精神科、精神康复科、心理科、睡眠医学科、神经内科。上述科室学科综合实力领先，临床专科诊治优势突出，能够为患者提供优质的医疗服务。
1、精神科
是地区最早采用中西医结合治疗精神病的科室，是医院开展“优质护理服务”示范病房。运用中西传统医学与现代精神医学有机结合，诊治精神分裂症、神经症、酒精性精神病、抑郁症等疾病以及其他心理问题。
2、精神康复科
设施完善，配备有计算机认知矫正治疗仪和认知评估系统、心率生物反馈治疗仪等先进设备，在区内率先引进多项康复新技术，为经过急性期治疗、病情稳定、处于康复期的精神或心理障碍患者提供专业的康复治疗及指导。
3、心理科
是医院重点精神科亚专科之一，也是全区较早全开放式以治疗老年精神、心理障碍为主的诊疗中心。设施完善，在诊治各种老年期精神障碍、老年痴呆、记忆障碍、老年焦虑抑郁障碍或躯体形式障碍、青少年期情绪行为问题或障碍早期干预等方面具有较高水平。
4、睡眠医学科
是广西区内较早将睡眠医学作为一门独立学科系统研究的综合临床科室，是集睡眠障碍预防、监测、诊断、治疗、教学和科研为一体的专科。擅长失眠、睡眠呼吸障碍、异态睡眠等各类睡眠障碍以及焦虑症、抑郁症等的诊治，临床经验丰富。
5、神经内科
是柳州市最早创建的治疗神经系统疾病的科室，承担理论教学及临床技能培训等任务。设施完善，擅长治疗脑梗塞、脑出血、脑炎、脑膜炎、癫痫、帕金森病等神经系统疾病，临床经验丰富。