上海治疗肝病排名靠前的是复旦大学附属华山医院感染病科、上海交通大学医学院附属瑞金医院感染科、上海交通大学医学院附属仁济医院消化内科。华山医院感染病科是国家重点学科，病毒性肝炎个体化治疗居国内前沿；瑞金医院感染科在重症肝炎研究领域闻名海内外，多项肝病诊疗技术全国领先；仁济医院消化内科是国家重点学科牵头单位，肝病临床与科研实力雄厚。
1、复旦大学附属华山医院 感染病科
该科室是国家首批博士点、国家重点学科，也是国内重要的病毒性肝炎相关肝病临床医疗中心之一。学科创始人戴自英教授是我国临床微生物学奠基人，现任科领导包括张文宏等知名教授。
在病毒性肝炎的免疫发病机制、耐药监测及个体化治疗方面优势突出，拥有先进的分子生物学诊断技术，可开展肝炎病毒变异检测、基因分型等特色项目，承担多项国家级科研课题，荣获20余项国家级、省部级科学成果奖，诊疗与科研水平稳居国内前列。
2、上海交通大学医学院附属瑞金医院 感染科
该科室以重症肝炎发病机制及治疗为传统主攻方向，曾主持多项国家攻关课题，为提升我国重症肝炎救治水平作出突出贡献，闻名海内外。目前在病毒变异研究、慢性乙丙型肝炎抗病毒治疗优化及耐药检测、肝移植术后肝炎复发防治等方面居于全国领先地位，是全球多中心临床药理基地，积极参与抗肝炎病毒药物临床疗效评价，科研实力雄厚，临床诊疗经验丰富。
3、上海交通大学医学院附属仁济医院 消化内科
该科室是国家重点学科牵头单位、国家临床重点专科、上海市消化内科临床医学中心，以上海市消化疾病研究所为依托，由江绍基院士和萧树东教授共同奠基。
学科在病毒性肝炎、肝硬化等肝病的临床诊疗与研究方面成果显著，开展肝炎病毒定量检测、基因测序等先进技术，参与国内肝病诊疗指南制定，每年承担多项国家级科研项目，发表多篇高水平SCI论文，荣获多项国家科技进步奖，综合实力居国内先进行列。
4、上海长海医院 消化内科
该科室是国家消化病临床医学研究中心、国家重点学科、国家临床重点专科，在李兆申院士带领下，综合实力强劲。
学科虽以胰腺疾病、消化道肿瘤诊治为特色，但在肝胆胰疾病相关诊疗方面同样具备优势，可开展与肝病相关的消化内镜微创治疗、并发症干预等技术，科研成果丰硕，承担逾百项国家级科研项目，荣获6项国家科技进步二等奖，牵头制定多项行业指南，诊疗技术与科研水平同步领先。
5、复旦大学附属中山医院 消化科
该科室是卫生部首批临床重点专科、内科博士点和博士后流动站，在全国消化病学专科排行榜中稳居前列。
学科在门脉高压、慢性肝病、肝硬化及其并发症的诊断和防治方面处于国内领先地位，建立了肝纤维化无创诊断及肝硬化综合防治体系，全球率先发现“土三七”致肝窦阻塞综合征的毒性成分。承担多项国家级科研课题，发表多篇顶级期刊论文，荣获多项省部级以上科技奖项，诊疗技术全面且精湛。
