黄山针灸科医院排名靠前的是黄山市人民医院中医科、祁门县中医医院中医科、祁门县人民医院中医科等，黄山市人民医院中医科2013年获评全国综合医院中医药工作示范单位，依托中医馆开展包含针灸在内的多种中医诊疗手段；祁门县中医医院中医科由多名主治医师以上职称人员组成，对腰痛、头痛这类适合针灸干预的痛证具备诊疗优势；祁门县人民医院中医科门诊开展针灸治疗，针对常见病多发病做中西医结合处置。
1、黄山市人民医院 中医科
该科室组建于1956年，建成具备浓郁中医文化氛围的中医馆，2013年被评为全国综合医院中医药工作示范单位，2018年成立叶九斤省名中医工作室，承担安徽省医学院校理论授课、临床见习以及进修人员带教工作。该科室立足传统中医药理论并结合现代医学技术，除中药内服调理之外，也开展针灸相关外治，针对颈肩腰腿痛、紧张性头痛、痛经、失眠等病症疏通经络，缓解躯体不适。该科室推进新安医学挖掘整理以及古方研究，拿到省市级科技奖，将针灸与中药方药搭配使用，同时覆盖脾胃、肺系、妇科多系统疾病的门诊诊疗。
2、祁门县中医医院 中医科
该科室由多名主治医师以上职称的医务人员组成，处理中医科常见病、多发病以及疑难病，在腰痛、头痛、腹痛、胃痛各类痛证，还有月经不调、乳腺增生等妇科病症方面有诊疗优势。该科室可开展针灸、艾灸等中医外治手段，针对腰肌劳损、寒凝痛经、外感后遗头痛开展经络调治，减轻疼痛以及气血阻滞带来的各类躯体症状。该科室以门诊辨证施治为主要模式，针刺外治可以和内服汤剂相互配合，面向县域内就诊人群，兼顾痛证、妇科、男科多类疾患的整体调理。
3、祁门县人民医院 中医科
该科室技术力量雄厚，门诊主要采用中医、中西医结合、针灸开展诊疗，肝病为该科室治疗专长。该科室运用针灸干预肢体痹痛、脾胃气滞带来的身体不适，面对体虚兼有疼痛表现的就诊者，针刺施治的同时兼顾脏腑体质调养。该科室在肝病、肾病及肿瘤疑难杂症上积累相应临床经验，能够接收疼痛病症同时合并肝肾基础疾病的患者，完成综合性的中医门诊处置。
