温州胃肠外科医院比较权威的是温州医科大学附属第一医院、温州医科大学附属第二医院、温州市人民医院。
温州医科大学附属第一医院胃肠外科为浙南闽北规模最大的胃肠道诊疗中心，学科整体水平省内领先、部分技术国内领先。温州医科大学附属第二医院胃结肠外科是浙江省临床重点专科，科研与微创实力突出。温州市人民医院普通外科为省市共建重点学科，综合诊治能力位居全国前列。
1、温州医科大学附属第一医院 胃肠外科
温州医科大学附属第一医院胃肠外科是全国胃肠道肿瘤 MDT 示范单位。学科整体水平省内领先，部分技术国内领先，擅长胃肠道肿瘤、间质瘤、肠梗阻、肠瘘、营养支持及减重手术。
科室常规开展腹腔镜、3D 及荧光腹腔镜等微创根治术，年胃肠肿瘤诊治量大，诊疗规范微创。主持国家自然科学基金 8 项，获省科技进步二等奖等多项奖励，为国家住培外科重点基地。
2、温州医科大学附属第二医院 胃结肠外科
温州医科大学附属第二医院胃结肠外科拥有省肿瘤转化国际科技合作基地及市胃肠专病中西医结合重点实验室，获省科技进步一等奖。团队博士占比极高，以微创、加速康复、精准医疗为特色，是浙南闽北首批开展达芬奇机器人手术的科室。
科室擅长胃结直肠肿瘤、减重代谢、胃食管反流病及外科营养，微创手术占比高。承担多项国家级省部级课题，多篇论文发表于国际高水平期刊。
3、温州市人民医院 普通外科
温州市人民医院普通外科引进上海顶尖医院专家团队，擅长肝胆胰、胃肠肿瘤、疝外科、血管外科及代谢外科。多项技术省内乃至温州领先，包括精准肝切除、改良 ALPPS 术、胃肠癌肝转移同期根治、荧光腹腔镜手术、腹腔热灌注治疗等，肝胆结石与常见疝病实现全面微创化与快速康复。
4、温州市中西医结合医院 普外科
温州市中西医结合医院普外科常规开展肝胆、胃肠、甲状腺乳腺、血管、腹壁疝等各类普外科手术，腹腔镜技术成熟，早在 2000 年即开展腹腔镜胆囊切除等多项微创术式，市内率先开展多种无张力疝修补术。
科室坚持中西医结合诊疗特色，发表学术论文 30 余篇，多项省厅级、市局级课题立项，部分成果获科技进步奖。
5、温州市中医院 西医外科
温州市中医院西医外科常规开展胆囊、甲状腺、胃肠肿瘤、泌尿系结石、乳腺等疾病诊疗，腹腔镜技术成熟。特色为中西医结合治疗急性胆管炎、胆结石、胃食管返流、乳腺增生等，对消化道肿瘤晚期患者可有效改善生活质量。完成多项市级课题，在中西医结合外科治疗方面形成稳定特色与临床优势。
