福州医院呼吸科强的是福建医科大学附属第一医院、福建医科大学附属协和医院、福建省立医院等。福建医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科是福建省呼吸疾病临床重点专科；福建医科大学附属协和医院呼吸科是福建省呼吸疾病诊疗、教学和科研的重点单位；福建省立医院呼吸内科2019年、2021年获复旦专科声誉排行榜——华东区呼吸专业提名。
第一名：福建医科大学附属第一医院-呼吸与危重症医学科
福建医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科是福建省呼吸疾病临床重点专科、全国首批PCCM（呼吸与危重症医学科）规范化建设三级医院优秀单位、中国医师协会首批PCCM专科医师规范化培训基地。科室在睡眠呼吸障碍性疾病、肺血管疾病、慢性气道疾病、间质性肺疾病、呼吸危重症等疾病的医疗水平位列省内前茅。连续6年荣获复旦专科声誉排行版（华东区）提名。
第二名：福建医科大学附属协和医院-呼吸科
福建医科大学附属协和医院呼吸科是福建省呼吸疾病诊疗、教学和科研的重点单位。可开展开展肺功能全套测试、支气管激发试验、支气管扩张试验、纤维支气管镜检查等多种诊疗操作。对各种呼吸道疾病如慢性阻塞性肺病、肺部结节、肺气肿、肺心病、支气管哮喘等呼吸科的疑难杂症、少见病等均具有极丰富的诊断和治疗经验。
第三名：福建省立医院-呼吸内科
福建省立医院呼吸内科是该省最早独立建制的学科，为福建省医师协会呼吸内科医师分会会长单位、福建省预防医学会呼吸病预防与控制专业委员会主任委员单位、福建省呼吸内科医疗质控中心、福建省感染性疾病质控中心、福建省肺癌规范化诊治示范中心、福建省慢阻肺防治中心。2017年获批国家首批呼吸与危重症医学科（PCCM）培训基地，2018年获国家卫健委PCCM规范化建设三级医院优秀单位，2019年、2021年获复旦专科声誉排行榜——华东区呼吸专业提名。
第四名：福建医科大学附属福州市第一医院-呼吸与危重症医学科
福建医科大学附属福州市第一医院呼吸与危重症医学科，为该医院的重点学科，现已成为福州市卫健委临床重点专科。医疗技术力量雄厚、综合实力强，逐渐形成了自身的诊疗特色，为福州市内呼吸界技术力量最强的科室之一。同时还是福建省住院医师内科规范化培训基地及硕士研究生培养基地。
第五名：中国人民解放军联勤保障部队第900医院-呼吸与危重症医学科
中国人民解放军联勤保障部队第900医院呼吸与危重症医学科，医疗设备精良，科室师资力量雄厚，集临床、科研、教学于一体。率先在福建省开展肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌产超广谱β-内酰胺酶的研究。开展的流感嗜血杆菌系列研究居国内领先水平。配合采用床边纤维支气管镜等先进医疗设备，进行纤支镜介入支气管肺泡灌洗及注药等综合治疗，抢救成功率达90％以上。
第六名：福建医科大学孟超肝胆医院-呼吸内科
福建医科大学孟超肝胆医院呼吸内科建立了全省首个多学科协作戒烟门诊。目前常规开展气管镜下介入、CT引导下经皮肺穿刺活检术、胸膜活检术、有创/无创机械通气、经鼻高流量给氧、多导/便携睡眠呼吸监测、肺通气功能、支气管舒张试验、呼出气一氧化氮检测等技术。在肺癌、肺部结节、肺部感染（尤其是免疫抑制宿主）、呼吸衰竭、慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘、间质性肺疾病、支气管扩张、睡眠呼吸暂停低通气综合征等呼吸系统疾病的综合诊治方面形成特色。
第七名：福建省立金山医院-呼吸与危重症医学科
福建省立金山医院呼吸与危重症医学科是医院集中监护和救治危重症患者的专业科室，面向全院收治内、外、妇、儿等各个专科的急危重症患者。能通过对患者病情进行连续、动态的观察和及时有效的干预，为重症患者提供规范的、高质量的医学生命支持和诊疗服务。
