黄山市人民医院擅长神经内科、重症医学科（ICU）、老年医学科、肿瘤内科、肺科，这些科室都有着高超的诊疗技术，患者可根据自身需求选择。
1、神经内科
是安徽省临床重点特色专科、黄山市临床重点专科、国家级住院医师规范化培训基地、国家级高级卒中中心建设单位。科室在本市率先独立开展了急性缺血性脑卒中静脉溶栓、血管内介入治疗等脑卒中关键救治技术，填补了黄山市的空白。其技术开展情况经国家脑防委评估在全国高级卒中中心综合排名靠前（最佳达第84位），在省内地市级三甲综合医院处于领先地位。
2、重症医学科（ICU）
属省内最先成立的综合性重症医学科之一，是安徽省“十二五”临床重点培育专科、省卫计委“重症监护专科护士临床教学基地”、中国医师协会重症医学分会全国委员单位。科室团队致力于危重症疾病的规范化诊治，注重及时准确诊断、快速合理治疗、客观衡量治疗效果，曾被评为“全国优质医疗服务示范科室”。
3、老年医学科
为安徽省重点特色专科，是黄山市三区四县老年疾病诊断、治疗、科研、保健中心，在该地区享有声誉。科室设备先进齐全，拥有有创、无创呼吸机、心脏除颤仪等多种设备，主要从事老年心血管疾病、呼吸系统疾病等多病并存患者的临床诊疗及老年综合征的管理工作。
4、肿瘤内科
是安徽省“十二五”重点特色专科、安徽省“癌痛规范化治疗”示范病房、安徽省“十三五”重点培育专科。科室与省内、国内著名肿瘤医院、肿瘤治疗中心有良好的协作关系，可为患者提供高水平、高质量的诊疗服务。常规开展以肿瘤化学治疗、靶向治疗、放射治疗、热疗为主的实体瘤规范化综合治疗、个体化治疗和姑息治疗等。
5、肺科
是医院最早设置的二级临床学科之一，是“十二五”安徽省临床医学特色专科。下设普通呼吸病房、呼吸重症监护病房等，拥有多位经验丰富的肺科医生和先进的医疗设备，能够提供全方位的肺科医疗服务。在人禽流感及新型甲型H1N1流感防治中，作为定点医院收治科室参与皖南山区疾病疫情控制工作，成绩显著。
