北京结核病治疗比较好的医院是首都医科大学附属北京胸科医院、中国人民解放军总医院和北京协和医院，首都医科大学附属北京胸科医院结核科率先在国内开展多项诊断新技术、新方法用于结核病和耐药结核病的诊断。中国人民解放军总医院结核病科是全军唯一的结核病临床诊疗、预防保健和科研教学为一体的综合性学部，北京协和医院感染科现已成为国内一家集医疗、科研、预防和人才培养的国家级传染病的医疗诊治、医学教育和医学研究中心。
第一名：首都医科大学附属北京胸科医院-结核科
首都医科大学附属北京胸科医院的结核科，能够规范化诊治各类结核病及相关疾病，肺部疾病的鉴别诊断和常见肺部疾病的规范化诊治等；对难治性耐药结核病(如耐多药、广泛耐药结核病)、难治性结核性脑膜炎、难治性支气管结核、脊柱结核伴截瘫、复杂性难治性结核性脓胸、严重基础疾病合并结核病、特殊人群结核病等诊治具有丰富的经验，部分已达国际领先水平；率先在国内开展多项诊断新技术、新方法用于结核病和耐药结核病的诊断。
第二名：中国人民解放军总医院-结核病科
中国人民解放军总医院结核病科，是全军唯一的结核病临床诊疗、预防保健和科研教学为一体的综合性学部，是国家重点学科呼吸内科的重要组成部分，是国家中西医结合治疗结核病重点学科、全军首批国家临床重点专科建设单位、全军结核病防治技术指导组组长单位、全军急性呼吸道传染病护理示范基地、北京市烈性呼吸道传染病救治基地、全军结核病防治重点实验室。学部下设结核病科、结核病防治队两个亚专科和结核病研究所。
第三名：北京协和医院-感染内科
北京协和医院感染科是北京协和医院最早成立的科室之一，现已成为国内一家集医疗、科研、预防和人才培养的国家级传染病的医疗诊治、医学教育和医学研究中心。北京协和医院感染科是感染性疾病博士学位授予点、卫生部临床重点学科。在复旦大学医院管理研究所最佳专科声誉排行榜名列第七。北京协和医院利用综合医院的多学科优势，建立了具有特色的多学科合作的“协和综合模式”，擅长结核、艾滋病、肝炎等疾病的治疗。
第四名：北京大学第一医院-抗感染科
北京大学第一医院抗感染科由我国著名临床药理学家李家泰教授创建并任首任所长。为我国第一个临床药理研究所，是我国临床药理高级学术研究机构和抗生素研究中心之一，也是我国最早的卫生部药物临床研究基地。主要收治发热待查、呼吸道感染、尿路感染、皮肤软组织感染等患者，在结核病的治疗方面经验丰富。
第五名：首都医科大学附属北京地坛医院-感染性疾病诊疗中心
北京地坛医院感染性疾病诊疗中心下辖感染一科、感染二科（共有病床68张）和皮肤、性病门诊。中心收治除单纯结核病以外的所有传染性疾病。中心在各种传染病的诊断鉴别诊断，尤其是发热待查、腹泻待查、皮疹待查、黄疸待查、肝功异常原因待查及中枢神经系统感染等方面积累了丰富的经验；在重症传染病，如暴发性流脑、乙脑、重症流行性出血热、SARS等传染病的抢救治疗方面有着较高的水平，在病毒性肝炎的抗病毒治疗、慢性肝病、肝硬化及其并发症的诊治方面亦有很深的造诣。
第六名：北京大学第三医院-感染疾病科
北京大学第三医院的感染疾病科是一个完整独立的临床科室，有良好的就医环境，该科室开展急性/慢性乙型肝炎、丙型肝炎的规范化抗病毒治疗。同时还承担各种肝炎、肝病相关知识的咨询，如肝病相关化验的解释、肝病患者生活饮食运动注意事项、乙肝携带者的管理、乙肝的预防及母婴阻断等，在结核病的综合治疗方面经验丰富。
第七名：北京大学人民医院-感染科
北京大学人民医院感染病科是国家临床重点专科，以感染疑难重症病例的病原诊断、治疗和研究为特色，依托于北京大学人民医院丰富的感染病例资源、检验科全面的病毒检测能力和微生物实验室全面的细菌、真菌检测能力，根据感染性疾病的病原复杂性、涉及人体器官系统多样性特点，按照专业特点分为感染病病毒组、细菌组、真菌组、传染病组、病毒性肝炎组等多个技术全面的专业团队。感染病科病房主要收治各种感染性疾病，包括发热原因待查、各部位感染、结核病等。近年来，在中国医院学科影响力排行榜多次取得前十位的成绩，疾病的研究和诊治处于国内同行的领先地位。
第八名：北京天坛医院-感染科
北京天坛医院的感染科是感染疾病诊疗和传染疾病防控的专业科室，包括感染科门诊、发热门诊、肠道门诊和感染科病房，在肺部感染及其他各器官感染诊疗方面逐渐形成科室诊疗特色，还擅长不明原因发热患者的鉴别、诊疗，多学科协作进行各类脓肿的诊疗等。曾经诊疗特殊病例包括盆腔组织脓肿、化脓性胆管炎、腰椎结核伴寒性脓肿、恙虫病、布氏杆菌病等。
第九名：首都医科大学宣武医院-感染性疾病科
首都医科大学宣武医院感染性疾病科由发热门诊、肝炎门诊、肠道门诊、感染病专家门诊组成，各有独立的候诊区、诊室，发热门诊还有独立的放射科。该科承担各种感染性疾病的诊治、疑难感染的会诊、指导抗菌药物的应用等临床工作，在结核病等传染病筛查、防控方面发挥着重要作用。发热门诊诊治各种感染性疾病引起的急性发热，肠道门诊诊治各种急性感染性腹泻，肝炎门诊诊治各种急慢性肝炎、肝硬化及其它肝功能异常。
