重庆消化科医院排名靠前的是陆军军医大学第一附属医院消化科、重庆医科大学附属第一医院消化内科、陆军军医大学新桥医院消化内科等。陆军军医大学第一附属医院消化科是国家临床重点专科、全军消化病研究所依托科室，2022年、2023年连续获得复旦排行榜消化病学提名，亚专科诊疗能力处于国内领先地位。重庆医科大学附属第一医院消化内科是重庆市消化疾病诊疗中心，内镜诊疗技术达国内先进水平，消化专科年门诊量及内镜手术量居西部医院领先梯队。陆军军医大学新桥医院消化内科是国内首家日本PENTAX内镜培训中心落地科室，2023年获复旦排行榜消化病学提名，医教研综合实力在全国享有盛誉。
1、陆军军医大学第一附属医院 消化科
该科室成立于1956年，是国家首批、全军最早的消化系病硕士及博士学位授权点、博士后流动工作站，2007年获评国家重点（培育）学科，2016年获评国家临床重点专科，2022年、2023年连续入选复旦排行榜消化病学提名科室，同时入选中国医院科技影响力排行榜消化病学上榜科室。科室现有享受国务院政府特殊津贴专家2人、国家优青1人。先后承担各级课题100余项，发表SCI论文100余篇，获国家科技进步奖二等奖1项。科室下辖2个病区、消化内镜中心及专科实验室，年门诊量近20万人次，胃肠镜年均检查7万余例，内镜下微创诊治、中晚期肝病综合治疗等亚专业处于国内领先地位。
2、重庆医科大学附属第一医院 消化内科
该科室创建于1957年，为博士、硕士学位授予点，国家临床药理基地，重庆市消化疾病诊疗中心，是集临床、内镜诊疗、科研、教学于一体的现代化消化内科，内镜诊疗水平达国内先进。科室覆盖袁家岗本部、虎头岩一分院区、渝北金山院区，年消化专科门诊量11万人次，年住院患者约3200人次，年胃镜检查3.2万人次，胃镜下各种手术治疗约3900人次，诊疗体量居西部医院领先水平，累计获国家自然科学基金8项、省部级科研基金20余项，发表SCI及CSCD论文200余篇，肝胆胰学组在多个学会中担任组长单位。
3、陆军军医大学新桥医院 消化内科
该科室始建于1952年，1959年组建为独立专科，1978年获批硕士学位授权点，1991年获批博士学位授权点，2023年获复旦排行榜消化病学提名，2002年成立国内首家日本PENTAX内镜培训中心，是集医教研于一体的临床三级学科，在全国享有盛誉，年门诊量约4万余人次，年收治病员3000多人次，内镜中心年开展胃肠镜检查2万余人次，其中治疗性内镜1800例次，常规开展ERCP、食管静脉套扎、食管支架置入等内镜技术。科研层面以胰腺疾病诊治、幽门螺杆菌防治、内镜下治疗学等为核心方向，参与多项国家自然科学基金、863重点项目研究。
4、重庆医科大学附属第二医院 消化内科
该科室是重庆市重点学科、重庆市临床重点专科、重庆市消化内镜医疗质量控制中心，为硕士博士学位授予点、博士后流动站，整体实力位居西部领先行列。科室实行“一科两部”布局，覆盖渝中院区与江南院区，年门诊量6万余人次，年住院患者5000余人次，年胃肠镜诊疗近4万人次。科研上累计获国家自然科学基金20项、省部级基金40余项，总资助经费1300余万。诊疗特色上，食管胃静脉曲张内镜下治疗手术量居重庆地区首位，消化道早癌诊疗水平在重庆市名列前茅。
5、重庆大坪医院 消化内科
该科室综合水平在全军及重庆市三甲医院中处于领先地位，收治范围覆盖胃肠道疾病、急慢性肝病、胰腺疾病、消化道出血、消化系统肿瘤等消化系统危急重症。科室特色诊疗方向明确，在慢性肝病诊治、消化道早癌内镜下诊断及治疗、血管介入技术应用及胃肠动力紊乱疾病诊治上具有鲜明特色。针对酒精性及非酒精性脂肪肝、肝纤维化、肝硬化、肝癌、重症肝炎等肝病的内科治疗有系统深入研究，先后开展TIPS治疗肝硬化门脉高压出血、球囊扩张及支架治疗Budd-chiarri综合症等技术，完成近百例肝活检术，还运用CTA、CTAP技术确诊100余例微小肝癌，在消化系统肿瘤血管介入治疗领域积累了扎实的临床经验。
