重庆甲状腺科医院排名靠前的是陆军军医大学第一附属医院普外科、重庆医科大学附属第一医院普通外科、陆军军医大学新桥医院普通外科等。陆军军医大学第一附属医院普外科为国家重点学科、重庆市医学重点学科，2023年获全国专科声誉排名提名，是国内知名的普通外科诊疗平台；重庆医科大学附属第一医院普通外科是国家临床重点专科，设甲乳亚专业，可开展复杂甲状腺肿瘤切除、甲状腺微创治疗等特色技术；陆军军医大学新桥医院普通外科为博士学位授予学科，设有乳腺甲状腺血管外科病区，腔镜甲状腺手术技术成熟度居西南地区前列。
1、陆军军医大学第一附属医院 普外科
该科室前身是1930年成立的国民政府中央医院外科，2023年获全国专科声誉排名提名，是集医疗、科研、人才培养为一体的国内知名普通外科，为博士学位授权学科、国家重点学科、重庆市医学重点学科。科室配备多功能数字化腹腔镜及超声手术系统等国内一流诊疗设备，年门急诊量36000人次以上，年收治病人5000人次以上，年手术量3000台次以上，治疗质量高、并发症少，疗效居国内先进水平。科研方面，科室承担国家、军队及重庆市多项科研课题，先后获国家科技进步二等奖1项、军队科技进步一等奖1项等各级奖项，获国家发明专利3项，同时担任中华医学会全国普外专委会多学组委员等数十项行业任职，是十余种外科核心杂志的编委单位。
2、重庆医科大学附属第一医院 普通外科
该科室1956年由上海第一医学院老一辈外科专家组建，是国家临床重点专科、重庆市普通外科（含肝胰小肠移植）医疗质量控制中心，1993年获批博士学位授权点及博士后流动站。科室设甲乳、血管等4个亚专业共8个病区，可开展复杂甲状腺肿瘤切除术、甲状腺肿瘤微创治疗、甲状旁腺移植等特色技术。科室年均门诊量达127252人次，年均手术量8059台，重庆市外患者占比26%，诊疗能力达国内先进水平。科研方面，科室创办《中华内分泌外科杂志》，承担多项国家级科研课题，获重庆市自然科学奖一等奖等成果，学科影响力突出。
3、陆军军医大学新桥医院 普通外科
该科室创建于1950年，是集医疗、教学、科研为一体的重点学科，为博士、硕士学位授予学科，设有博士后流动站，下辖微创外科中心、胃肠病区、乳腺甲状腺血管外科病区，展开床位80张，临床诊治水平达国内先进、部分项目达国内领先，其微创外科中心为国家腹腔镜外科培训中心，可常规开展经胸前皮肤切口内镜下甲状腺包块切除术，2002-2004年累计开展12例，为当时西南地区最多例数。科室年均门诊量约37000人次，年均住院病人逾3780人次，患者覆盖全国十余省市；科研方面获国家自然基金十余项，累计资助金额近800万元，承办中华医学会腔镜学组年会等重量级学术会议。
4、重庆医科大学附属第二医院 普外科
该科室由一批临床经验丰富的主治医师以上职称的医务人员组成，熟悉普外科常见病、多发病、疑难病的诊治，甲状腺疾病作为普外科常规诊疗病种，科室可依托成熟的普外诊疗体系为患者提供对应诊疗服务。科室在创伤、肠道肿瘤、胃肿瘤、乳腺肿瘤、胆囊息肉、胆结石、脐疝、腹外疝、肝囊肿、肝脓肿等多类疾病的诊疗方面具有显著优势，能够为合并其他普外科基础疾病的甲状腺疾病患者提供一体化诊疗方案，覆盖重庆本地及周边地区患者的就诊需求。
5、重庆大坪医院 乳腺甲状腺外科
该科室是集医、教、研为一体的国家重点学科，为博士学位授予单位，也是重庆市乳腺肿瘤早期诊断和微创手术示范中心、重庆市青年文明号单位。科室配备麦默通/安珂乳腺微创旋切系统、甲状腺术中神经监测仪、腔镜手术系统、乳腺前哨淋巴结活检系统等先进专科设备，可开展各类甲状腺疾病的精准、微创诊疗。2010年以来，科室先后获科技进步二等奖1项、重庆市科技进步二等奖1项，获国家发明专利及实用新型专利40项，主持国家自然科学基金2项、国家科技惠民计划项目1项、“863计划”子课题1项及多项重庆市科研课题，科研实力强劲。
