昆明神经外科医院排名比较靠前的是昆明医科大学第一附属医院、昆明医科大学第二附属医院、解放军联勤保障部九二零医院。
昆明医科大学第一附属医院神经外科是云南省最早成立的神经专科，设备先进亚专业齐全，综合实力国内先进。昆明医科大学第二附属医院神经外科拥有院士工作站及多个省级诊疗中心，高难度手术占比高区域影响力大。解放军联勤保障部九二零医院颅脑脊髓外科设备齐全功能神经外科技术省内领先。
1.昆明医科大学第一附属医院 神经外科
昆明医科大学第一附属医院神经外科由我国神经外科先驱创立，是云南省神经外科临床重点专科、博士硕士授权点，拥有复合手术室、机器人手术显微镜等国际先进设备。科室在复杂颅内血管病、颅底肿瘤、脑深部病变、功能神经外科等领域达到国内先进水平，承担多项国家自然科学基金项目，获多项省级科技奖励，同时承担全省神经外科医师培训与基层技术推广工作。
2.昆明医科大学第二附属医院 神经外科
昆明医科大学第二附属医院神经外科是赵继宗院士工作站单位，拥有云南省帕金森病DBS治疗中心、神经调控临床中心等多个省级平台，为国家级规培基地。科室以显微颅底外科、功能神经外科、脊柱脊髓外科为特色，主持多项国家自然科学基金项目，与国内多家顶尖神经外科中心密切合作，在中枢神经系统疑难疾病诊治上省内领先。
3.解放军联勤保障部九二零医院 颅脑脊髓外科
解放军联勤保障部九二零医院颅脑脊髓外科拥有西南X刀中心、细胞刀治疗研究中心，与上海华山医院共建诊疗中心，专科设备价值数千万元。科室在颅脑创伤、颅内肿瘤、脑血管病及神经功能性疾病诊治上经验丰富，立体定向与功能神经外科治疗帕金森病、三叉神经痛等效果突出，开展多项新技术新业务，获多项军队及省级科技进步奖。
4.云南省第一人民医院 神经外科
云南省第一人民医院神经外科技术水平达国内先进，率先在省内开展经蝶垂体瘤切除术、脑干肿瘤切除术、颅内动脉瘤超早期夹闭术等多项高难度手术，填补省内技术空白。科室在颅底手术、听神经瘤功能保留等方面省内领先，独家开展多项特色手术技术，承担多项省部级科研项目，对疑难重症诊治正确率高、救治能力突出。
5.云南大学附属医院 神经外科
云南大学附属医院神经外科是省级临床重点专科、国家高级卒中中心建设单位，与北京天坛医院共建国家神经疾病区域中心，为省神经外科专科联盟副理事长单位。科室在颅内动静脉畸形栓塞、颈内动脉海绵窦瘘栓塞、神经内镜微创治疗等领域国内先进、省内领先，作为神经介入培训基地培养大量专业人才，患者覆盖全国多省市及东南亚地区。
