云南神经外科医院排名比较靠前的是昆明医科大学第一附属医院、昆明医科大学第二附属医院、解放军联勤保障部九二零医院。
昆明医科大学第一附属医院神经外科是云南神经外科的开创者，拥有双病区和众多国家级、省级平台，技术水平达国内先进，引领省内学科发展。昆明医科大学第二附属医院神经外科以高难度手术为特色，功能神经外科优势突出，科教实力雄厚，与国内顶尖医院深度合作。解放军联勤保障部九二零医院颅脑脊髓外科设备齐全，立体定向与功能神经外科技术省内领先，诊疗经验丰富。
1.昆明医科大学第一附属医院 神经外科
昆明医科大学第一附属医院神经外科分为神经外一科、神经外二科，由我国神经外科先驱李秉权教授创立，是云南最早的神经专科。拥有神经外科博士、硕士培育点，云南省神经系统疾病临床医学中心等多个省级、国家级平台，配备国际先进手术设备。神经外一科侧重综合诊疗，神经外二科以微创为特色，率先建立省内微创神经外科技术平台。擅长各类颅脑肿瘤、脑血管病、功能神经疾病等诊治，开展多项高难度手术，承担多项国家及省级科研课题，获多项科技成果奖，培养大量神经外科人才，整体水平达国内先进。
2.昆明医科大学第二附属医院 神经外科
昆明医科大学第二附属医院神经外科是集临床、教学、科研于一体的骨干科室，是中国神经外科专科医师规范化培训基地、国家神经系统疾病临床医学研究中心云南省分中心，拥有赵继宗院士工作站等平台。以显微颅底外科、功能神经外科等为特色，开展各类高难度神经系统疾病手术，80%以上为三、四级手术。配备齐全先进诊疗设备，注重神经功能保护，主持多项国家自然科学基金，发表多篇SCI论文，与国内顶尖医院密切合作，在省内神经外科领域具有重要影响力。
3.解放军联勤保障部九二零医院 颅脑脊髓外科
解放军联勤保障部九二零医院颅脑脊髓外科诊疗经验深厚，组建西南X刀中心、细胞刀治疗研究中心，是云南—上海神经外科诊疗中心依托单位。拥有X-刀、立体定向系统等价值数千万元的先进设备，是省内神经外科设备及手术范围最齐全的科室之一。立体定向与功能神经外科治疗开展20年且省内领先，擅长颅脑创伤、颅内肿瘤、脑血管病诊治，三叉神经痛、面肌抽搐治疗治愈率达98%，开展多项新技术，获军队及省级科技进步奖，综合实力强劲。
4.云南省第一人民医院 神经外科
云南省第一人民医院神经外科是省内技术力量最强的神经外科专科之一，率先在省内开展经蝶垂体瘤切除术、脑干肿瘤切除术等多项手术，填补省内空白。在经平胼胝体穹隆间入路三脑室肿瘤切除术等领域居省内之首，颅底手术、听神经瘤切除术等水平省内领先，获国内同行认可。独家开展颅内恶性肿瘤一期根治术等先进技术，淘汰落后诊疗操作，提高治愈率。承担多项省厅级科研项目，获多项科研成果奖，疑难病诊断正确率高，危急重症救治及时有效。
5.云南大学附属医院 神经外科
云南大学附属医院神经外科是省级临床重点专科，国家卫健委高级卒中中心建设单位，与北京天坛医院共建国家神经疾病区域中心，是云南省神经介入限制性技术培训基地。擅长静脉入路栓塞颅内动静脉畸形等国内领先技术，颈内动脉海绵窦瘘栓塞等技术省内领先。承担多所高校教学任务，培养大量神经介入及神经外科人才，获云南省卫生科技成果三等奖。手术患者覆盖全国17个省市及东南亚国家，依托与北京天坛医院的合作，持续提升西南地区神经疾病诊疗水平。
