辽宁中医药大学附属医院擅长的科室有肾内科、耳鼻喉科、儿科、内分泌科、肿瘤科等，这些科室设备齐全、技术力量雄厚，可以为患者提供高水平的治疗。
1、肾内科
辽宁中医药大学附属医院肾内科是国家中医药管理局重点学科，是集医疗、教学、科研为一体的综合性科室。由门诊、病房、血液净化中心、中医内科教研室四部分组成。科室突出传统中医特色，充分发挥中医药优势，与西医技术有机结合，在治疗慢性肾脏疾病中占有明显优势。尤其在慢性肾衰竭、肾小球肾炎、肾病综合征、泌尿系统感染等优势病种方面，疗效显著，受到省内广大肾病患者好评。
2、耳鼻喉科
辽宁中医药大学附属医院耳鼻喉科是以医疗、教学、科研为一体的综合性学科，是国家级重点学科、重点专科，国家中医药管理局重点专科，辽宁省中医，中西医结合重点专科，辽宁省中医，中西医结合重点学科，是中医、中西医结合耳鼻咽喉科博士、硕士培养点。科内既具有中医药特色辨证治疗，又可开展常规和急诊手术治疗。
3、儿科
辽宁中医药大学附属医院儿科是国家中医药管理局“十五”重点学科及重点专科，拥有国家中医药管理局重点研究室—小儿肺炎毒热证研究室、中医药三级科研实验室—病毒室，是融科研、教学、临床为一体的综合科室。现有儿科门诊、专家门诊、急诊、病房、咳喘中心、脑瘫康复中心、教研室、研究室、病毒室等。科室还为中医儿科博士点、硕士点及中西医结合博士点，多名专家在全国中医界享有盛誉。
4、内分泌科
辽宁中医药大学附属医院内分泌科是卫生部国家临床重点专科，国家中医药管理局重点学科，辽宁省卫生厅中医、中西医结合重点专科，辽宁省教育厅重点学科中医内科学主要支撑学科，同时也是辽宁省及沈阳市中医特色专科。keshi技术力量雄厚，集医疗、教学、科研、保健于一体，中、西医并重，使内分泌代谢病的中西医综合防治水平处于省内领先。
5、肿瘤科
辽宁中医药大学附属医院肿瘤科是辽宁省成立最早的中医肿瘤治疗科室，能进行恶性肿瘤相关的血液学检测、影像学检查以及支气管镜、胃镜、肠镜等检查，能对肿瘤进行准确的病理诊断。病房常规开展恶性肿瘤西医化疗、内分泌治疗及靶向治疗，进行中医全程分阶段联合治疗。对于肠梗阻、胸腹腔积液等肿瘤合并症，能应用中西医结合的方法有效缓解症状。