治疗克罗恩病建议就诊于消化内科，重庆治疗克罗恩病排名靠前的医院分别为陆军军医大学第一附属医院消化科、重庆医科大学附属第一医院消化内科、陆军军医大学新桥医院消化内科，陆军军医大学第一附属医院消化科是国家重点（培育）学科、国家临床重点专科，内镜微创、肝病综合治疗等处于国内领先水平；重庆医科大学附属第一医院消化内科是重庆市消化疾病诊疗中心，内镜诊疗达国内先进，多项技术率先在西南地区开展；陆军军医大学新桥医院消化内科是国内首家日本PENTAX内镜培训中心，内镜技术精湛，科研教学实力雄厚，在全国享有盛誉。
1、陆军军医大学第一附属医院 消化科
科室是国家重点（培育）学科、国家临床重点专科、全军消化病研究所，拥有博士后流动工作站、国家临床药理基地等多项顶级头衔。内镜下微创诊治、中晚期肝病综合治疗等处于国内领先，可开展ESD、POEM、TIPS等高端技术，开设多个亚专科专病门诊及MDT诊疗平台。承担国家优青、国家自然科学基金等课题100余项，SCI论文100余篇，获国家科技进步奖二等奖1项，牵头制定多项行业规范，国际合作交流密切。
2、重庆医科大学附属第一医院 消化内科
科室是重庆市消化疾病诊疗中心、国家临床药理基地，内镜诊疗水平达国内先进，在西部医院中处于领先地位。率先在西南地区开展ERCP、EUS-BD、EUS-SVD等多项内镜四级手术，在消化道早癌、胆胰疾病、IBD慢病管理等领域成果突出。拥有先进内镜设备，科研实力扎实，承担国家自然科学基金8项，发表SCI及CSCD论文200余篇，培养博硕士130余名，学术影响力辐射西南地区。
3、陆军军医大学新桥医院 消化内科
科室是国内首家日本PENTAX内镜培训中心、博士及硕士学位授权点，集医教研于一体，在全国享有盛誉。内镜中心设备达世界一流，常规开展ERCP、息肉切除、食管静脉套扎等各类内镜治疗，技术成熟。重点围绕胰腺疾病、慢性肝病、幽门螺杆菌感染等方向开展科研，参与国家863、自然科学基金等重点项目，师资力量雄厚，多次获评优秀教学组，为全国培养大批骨干医师。
4、重庆大坪医院 消化内科
科室综合水平在全军及重庆市三甲医院中处于领先地位，诊疗范围覆盖消化系统各类危急重症。在慢性肝病诊治、消化道早癌内镜诊疗、血管介入技术应用及胃肠动力紊乱疾病诊治上特色鲜明，对脂肪肝、克罗恩病、肝硬化、肝癌等肝病研究深入。开展TIPS治疗肝硬化门脉高压出血、微小肝癌CTA/CTAP确诊等技术，成功完成近百例肝活检术，诊疗精准高效，临床疗效显著。
5、重庆医科大学附属第二医院 消化内科
科室是重庆市重点学科、临床重点专科，拥有重庆市消化内镜质控中心、肝病治疗研究中心等多个市级平台，位居西部领先行列。食管胃静脉曲张内镜下治疗在重庆地区手术量最大、最规范，消化道早癌内镜诊疗名列前茅，开展NOTES、CAES等多项内镜新技术。承担国家自然科学基金20项，获重庆市科技进步奖8项，SCI论文70余篇，培养博硕士190余名，诊疗与科研教学协同发展。
