东莞三甲医院排名靠前的是东莞市人民医院、东莞市松山湖中心医院、东莞市妇幼保健院等。其中东莞市人民医院是广东省博士后创新实践基地，微创、介入等多个医疗技术领域居省内先进水平；东莞市松山湖中心医院拥有多个东莞市重点专科和特色专科，诊疗技术达到广东省先进水平；东莞市妇幼保健院在2020年度国考中位列第32名，荣获国家示范孕妇学校等多项荣誉。
1、东莞市人民医院
该医院是一所大型综合性三级甲等医院，技术力量雄厚，在微创、介入等多个医疗技术领域居省内先进水平。医院是广东省博士后创新实践基地，是国家首批住院医师规范化培训基地。在科研方面也取得了很多成果，在医疗质量、服务态度等方面也获得了多项荣誉，如全国百姓放心示范医院、广东省文明单位等。
2、东莞市松山湖中心医院
该医院是一所集医疗、教学、科研、保健于一体的市属综合性三级甲等公立医院。医院技术引领，拥有多个东莞市重点专科和特色专科，如心血管内科、呼吸内科等。医院在人才方面也具有优势，在科研方面也取得了很多成果。医院秉承“惠育仁和、大医至善”的医院精神，提供优质医疗服务，并屡获全国人文品牌创新案例奖。
3、东莞市妇幼保健院
该妇幼保健院是一家非营利性三级甲等妇幼保健机构，集医疗、保健、科研、教学、基层指导于一体。医院承担了全市妇女儿童的医疗救治、师资培训、妇幼卫生指标监测和科学研究等工作任务。医院始终以保健为中心，保障妇女儿童健康，提供婚前、孕前检查服务等服务，提高人群健康管理水平。医院为南方医科大学非直属附属医院、遵义医学院珠海校区临床教学实践基地等，并多次获得国家级和省级荣誉称号。
4、东莞市滨海湾中心医院
该医院是一所现代化市属三级甲等综合医院，坚持公立医院的公益性，主要为滨海湾片区及周边地区群众提供全方位全周期健康服务。医院学科实力、服务能力和社会影响力居于全市前列，重点学科包括新生儿科、儿科、口腔科等。医院近年来推进现代医院管理制度建设和智慧医院建设，运用质量管理工具改进服务质量，取得了多项科研成果和专利。
5、广州中医药大学东莞医院（东莞市中医院）
该医院（东莞市中医院）是东莞地区唯一一家集医、教、研、康复和养生于一体的三级甲等现代化中医医院，是国家级非物质文化遗产“中医诊疗法——古本易筋经十二势导引法”传承基地。医院重视学科建设和名老中医传承，设有国医大师传承工作室、全国名老中医药专家传承工作室等。医院已形成博士后、硕士、本科多层次的教学体系，已培养博士后、硕士研究生等。