山东第一医科大学第一附属医院擅长的科室有呼吸内科、神经外科、妇科、耳鼻喉科、产科等，这些科室设备齐全、技术力量雄厚，可以为患者提供高水平的治疗。
1、呼吸内科
山东第一医科大学第一附属医院呼吸内科是国家临床重点专科建设项目；现为山东省呼吸区域医疗中心、山东省重点专科、国家呼吸与危重症医学科规范化建设“优秀学科”、国家PCCM专修基地、肺功能单修基地、呼吸介入单修基地、MICU\RICU单修基地、国家呼吸临床研究中心中日友好医院首批医联体单位、首批“国家呼吸临床研究中心核心单位”。诊室诊疗规范、整洁明亮。能为来自全国、全省各地患者提供全方位、高品质服务。
2、神经外科
山东第一医科大学第一附属医院神经外科是国家临床重点专科；山东大学985工程（Ⅱ期、Ⅲ期）重点学科、国家卫健委脑卒中筛查与防治基地、国家高级卒中中心建设单位，山东大学神经外科学硕士与博士授予单位，国家神经外科住院医师规范化培训基地。近五年累计承担国家科技重大专项、国家自然基金、中国博士后基金、省重大专项等10余项课题，发表SCI论文50余篇，主编著作3部，获得专利10余项。多次荣获教育部高校科技进步奖、山东省自然科学奖、山东省科技进步奖、山东省医学科技奖。
3、妇科
山东第一医科大学第一附属医院妇科是山东省临床重点专科；该科先后获得山东省女职工建功立业标兵岗、山东省巾帼文明示范岗、全省卫生系统两好一满意示范集体。是山东大学硕士、博士研究生培养单位，山东第一医科大学、潍坊医学院硕士研究生培养单位，国家卫计委首批住院医师规范化培训基地。主持山东大学教学改革课题2项，承担山东第一医科大学校级一流课程妇产科学建设。培养山东大学、山东第一医科大学研究生40余名，发表文章100余篇。
4、耳鼻喉科
山东第一医科大学第一附属医院耳鼻喉科是山东省临床重点专科；科室每年均举行山东省继续教育项目耳鼻喉解剖学习班，在省内尤其是合作医院取得较好的反响，共有70余人来科室进修。承担国家自然基金、山东省自然科学基金、山东省医药卫生科技发展计划等10项科研立项，获得山东省医学科学进步三等奖1项。发表论文18篇，其中SCI收录论文14篇，出版著作1部，取得专利7项，其中发明专利1项，实用新型专利6项。
5、产科
山东第一医科大学第一附属医院产科是山东省临床重点专科；承担山东大学、泰山医学院、潍坊医学院研究生、本科生教育，住院医师的规范化培训、进修医师培养等多个层面的教学工作。举办继续医学教育项目一项，出版著作4部，以第一或通讯作者在中华系列及SCI收录期刊发表论文8篇，科研立项4项，发明专利3项，在省级学会担任副主委1人。