福州新生儿科医院排名比较权威的是福建省儿童医院、福建医科大学附属第一医院、福建医科大学附属协和医院。
福建省儿童医院小儿外科新生儿先天畸形微创诊疗水平省内领先。福建医科大学附属第一医院儿科新生儿亚专科配套完善，科研与临床实力突出。福建医科大学附属协和医院儿内科新生儿专业高危儿管理与神经评估体系成熟。
1.福建省儿童医院 小儿外科
福建省儿童医院小儿外科在新生儿先天性畸形诊疗上造诣深厚，擅长腹腔镜微创治疗新生儿胆总管囊肿、先天性巨结肠、食管裂孔疝、肛门闭锁、肠旋转不良等多种疑难病症，诊疗水平位居省内前列。科室与国内顶尖儿科医院及美国医疗机构建立长期学术合作，在新生儿腹部恶性肿瘤、颈部病变、腹部创伤等规范化治疗方面经验丰富，为新生儿外科急重症提供精准微创救治。
2.福建医科大学附属第一医院 儿科
福建医科大学附属第一医院儿科是省级临床重点专科、国家级儿科规培基地及儿科学硕士点，新生儿亚专科建设完备，设有新生儿重症监护室、袋鼠护理病房等特色单元。配备新生儿振幅整合脑电、听力筛查、床旁超声等专业设备，开展高危新生儿救治与长期随访，承担多项省级科研项目，获25项科技成果奖，发表360余篇国内外学术论文，新生儿疾病综合诊疗与科研能力省内领先。
3.福建医科大学附属协和医院 儿内科
福建医科大学附属协和医院儿内科是福建省临床重点专科及省内最早的儿科硕博培养基地，新生儿专业聚焦高危儿系统管理，开展新生儿神经行为评估、GMS评估与脑功能监护。依托医院多学科优势，在新生儿遗传代谢病、罕见病、围生期急症救治上实力强劲，联合儿童心脏中心开展危重先心病急诊救治，多项新技术应用于新生儿疑难病症，整体诊疗水平达国内先进。
4.福建省立医院 儿科
福建省立医院儿科为国家级住院医师规范化培训基地、硕博研究生培养点，常年接收全省及邻近省份转诊的儿科疑难及危重病患儿，可开展儿童相关危重症救治。科室设儿科研究室支撑感染等疾病病原学检测，承担近 20 项国家级及省部级科研课题，获多项省科技进步奖，在儿童危重症转诊救治方面具备较强综合实力。
5.福建中医药大学附属人民医院 新生儿科
福建中医药大学附属人民医院新生儿科配备空氧混合仪、暖箱、蓝光治疗箱等专业救治设备，熟练开展新生儿窒息复苏、蓝光照射、抚触护理等特色项目。擅长新生儿窒息、吸入综合征、败血症、高胆红素血症、低血糖症等常见疾病规范化诊疗，对新生儿脐炎、脓疱疮、出血症等病症救治及时有效，为新生儿提供安全规范的专科诊疗与生命支持。
