云南甲状腺外科医院排名比较靠前的是昆明医科大学第一附属医院、昆明医科大学第二附属医院、解放军联勤保障部九二零医院。
昆明医科大学第一附属医院甲状腺疾病诊治中心是云南甲状腺外科龙头机构，学术与临床均达国内领先水平。昆明医科大学第二附属医院甲状腺乳腺外科拥有省内唯一甲状腺外科院士专家工作站，微创技术全面。解放军联勤保障部九二零医院普通外科腹腔镜甲状腺手术开展早，综合诊疗实力雄厚。
1.昆明医科大学第一附属医院 甲状腺疾病诊治中心
昆明医科大学第一附属医院甲状腺疾病诊治中心是云南省首个甲状腺外科临床研究中心、博士学位授予点，也是中国抗癌协会甲状腺癌专委会主委单位。学科牵头成立省内多个甲状腺专业学会，承担多项国家自然科学基金项目，参编多部国家级指南与共识。开展规范化甲状腺癌根治、功能性颈淋巴结清扫及多种腔镜甲状腺手术，术中神经监测、甲状旁腺保护等技术国内领先，牵头组建云南省甲状腺外科专科联盟，引领区域诊疗同质化发展。
2.昆明医科大学第二附属医院 甲状腺乳腺外科
昆明医科大学第二附属医院甲状腺乳腺外科设有云南省唯一甲状腺外科院士专家工作站，医师均为硕士以上学历，可开展全系列甲状腺开放及微创手术。特色开展经口、胸乳、腋窝等入路腔镜甲状腺手术、微波消融及细针穿刺活检，在巨大甲状腺肿、晚期甲状腺癌及甲状旁腺疾病诊治上经验丰富。科室与国内多家顶尖医院合作，承担省级科研项目，获多项教学与科研成果，诊疗水平位居全省前列。
3.解放军联勤保障部九二零医院 普通外科
解放军联勤保障部九二零医院普通外科在云南省率先开展腹腔镜甲状腺手术，技术成熟、复发率低、创伤小。科室以肿瘤防治为重点，在甲状腺癌规范化诊疗及微创治疗方面成果突出，同时具备复杂腹部外伤、肠瘘等危重病症救治能力。开展麦默通微创活检等先进技术，科研上参与国际合作项目及全军攻关课题，甲状腺疾病综合诊疗水平长期处于云南省领先地位。
4.云南省第一人民医院 乳腺甲状腺专科
云南省第一人民医院乳腺甲状腺专科由高年资医师组成，对甲状腺炎、结节、腺瘤、甲状腺癌等常见及疑难病症诊治经验丰富。科室擅长甲状腺良恶性疾病的规范化诊断与手术治疗，在乳腺甲状腺联合疾病诊疗上形成特色，能为患者提供稳定可靠的专科诊疗服务，是滇内重要的甲状腺疾病诊疗机构。
5.云南大学附属医院 普通外科
云南大学附属医院普通外科是国家临床重点专科，下设乳腺暨甲状腺外科亚专业，多项技术达国内领先水平。科室拥有高水平科研团队，承担国家自然科学基金等多项课题，获多项云南省科技进步奖。常规开展甲状腺良恶性肿瘤规范化手术及微创治疗，依托多学科协作与国际合作平台，在复杂甲状腺肿瘤诊治方面具备较强实力。
