曲靖三甲医院有曲靖市第一人民医院、曲靖市中医医院、曲靖市第二人民医院等数家，其中曲靖市第一人民医院是滇东地区首家西医医疗机构，曲靖市紧急医疗救援中心、曲靖市传染病医院、曲靖市肿瘤医院、曲靖市康复医院挂靠在该院；曲靖市中医医院拥有多个云南省中医名科以及曲靖市中医名科；曲靖市第二人民医院系国家级腹腔镜外科医师培训基地，同时也是上海复旦大学附属中山医院医疗技术协作中心。
第一名：曲靖市第一人民医院
曲靖市第一人民医院是一所集医疗、科研、教学为一体的大型三级甲等综合性医疗机构。医院是滇东地区首家西医医疗机构，经历了云南惠滇医院曲靖分院、曲靖中心卫生院、曲靖专区医院、曲靖地区医院、曲靖地区第一人民医院和曲靖市第一人民医院的建设和发展阶段。1993年被评为国家三级乙等医院。曲靖市紧急医疗救援中心、曲靖市传染病医院、曲靖市肿瘤医院、曲靖市康复医院挂靠在该院，现正积极创建全国三级甲等医院。
第二名：曲靖市中医医院
曲靖市中医医院，是一所以中医药为主、西医药为辅的综合性中医医院。医院建院以来长期坚持以传承和创新中医为根本，以现代化诊疗设施与技术手段为依托。医院的针灸科现已发展成为国家级重点专科和曲靖市中医名科；肛肠科为云南省中医名科，肺病科为曲靖市中医名科，肛肠科和肺病科列为“十二五”国家级重点专科建设科室；糖尿病成为云南省重点专病；脾胃病科、糖尿病科、骨伤科、推拿科、急诊科已成为曲靖市重点专科。
第三名：曲靖市第二人民医院
曲靖市第二人民医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健于一体的三级甲等综合医院。系国家级腹腔镜外科医师培训基地；上海复旦大学附属中山医院医疗技术协作中心、远程医学会诊中心/远程教育中心；四川大学华西医院/华西第二人民医院区域网络联盟医院；云南中医药大学附属曲靖综合医院；云南省住院医师规范化培训基地；曲靖医学高等专科学校的非直属附属医院；大理大学教学医院；为曲靖市区域腹腔镜微创外科诊疗中心。
第四名：曲靖市妇幼保健院
曲靖市妇幼保健院是云南省规模最大、历史最长的妇幼保健院。集医疗、预防、保健、计划生育、优质护理、科研教学为一体的公立性三级甲等新型现代化儿童妇产专科医院。拥有两个省级重点专科（儿科、妇产科）、四个市级重点专科（新生儿科、妇科、儿外科、血液科）。在全市及周边地区妇幼卫生行业中具有坚实的“领头羊”地位。
第五名：曲靖市第三人民医院
曲靖市第三人民医院，是曲靖市医学会心身医学专业委员会、曲靖市护理学会精神科专业委员会，曲靖市精神卫生质控中心挂靠单位。拥有飞利浦16排螺旋CT、数字X光机（DR）阿洛卡10彩超、800mA胃肠机、彩色经颅多普勒、双视频脑电图机、贝克曼库尔特全自动生化分析仪、高效液相色谱仪(监测药物浓度)、MECT治疗仪、睡眠监测仪等检查及治疗设备。
第六名：宣威市中医医院
宣威市中医医院，现已成为一所集医疗、急救、教学、科研、预防、保健、康复为一体的综合性“三级甲等”中医医院、云南中医学院附属医院、昆明医科大学和曲靖医专实习医院，同时也是迄今为止云南省县（市）级医院中唯一的一家“三甲”医院。医院的骨伤科、针推科、肛肠科和肺病科，先后成为云南省重点专科。医院其它临床科室，在不断地建设与发展中逐渐形成独自的特色与优势。
第七名：陆良县人民医院
陆良县人民医院现已发展成为一所集医疗、急救、教学、预防保健、康复为一体的县级综合性公立医院。医院科室分类较多，设备齐全，技术力量雄厚，可为噶广大患者提供优质医疗服务。
第八名：宣威市第一人民医院
宣威市第一人民医院是一所集医疗、教学、预防、保健、康复和科研、紧急救援为一体的国家二级甲等综合医院。现有骨科、普外科、妇产科、重症医学科、神经外科、心血管内科、麻醉科、护理8个在建省级临床重点专科。可常规开展胸腔镜、腹腔镜、宫腹腔镜，关节镜、椎间盘镜等手术。