济南市中西医结合医院擅长的科室有骨科、内分泌科、耳鼻喉科、肾病科、老年病科等。
1、骨科
济南市中西医结合医院骨科下辖骨一科、骨二科两个科室，是市中医、中西医结合骨伤医疗、教学、科研中心。现有医护人员23名，其中高级专业技术人员3名，拥有先进的德国尼万隆骨折愈合仪、CPM、床边X光机等诊疗设备，年住院病人800余人次，为医院创造了良好的社会效益和经济效益。
2、内分泌科
济南市中西医结合医院内分泌科，是省中医药临床重点专科，中医特色突出，西医技术精湛，擅长中西医结合治疗糖尿病及其急、慢性并发症、甲状腺疾病、骨质疏松、垂体瘤、肾上腺疾病、尿崩症、痛风高尿酸血症、肥胖症、更年期综合征、月经不调、色斑、座疮、脱发等疾病。科室还开展了糖尿病及其并发症、甲状腺疾病的非药物疗法，如穴位推拿、耳穴压豆等。
3、耳鼻喉科
济南市中西医结合医院耳鼻喉科是省级中医药临床重点专科，配备有先进的耳鼻喉科综合治疗台、日本进口奥林巴斯电子纤维喉镜、德国STORSZ鼻内镜系统等先进的检查诊疗设备。在慢性鼻炎、鼻窦炎、过敏性鼻炎等多种疾病的治疗方面形成一整套行之有效的诊疗方案。多年来业务范围不断拓展，开展了甲状腺良恶性肿瘤切除、颌骨囊肿切除术、鳃裂囊肿切除术以及腮腺、颌下腺、舌下腺等腺体手术。
4、肾病科
济南市中西医结合医院肾病科是省中医药临床重点专科，拥有德国百特血液透析机10台，血液滤过机1台，CRRT机1台，结肠透析机1台。科室成立30余年来，逐步形成了一套较为完备的肾病治疗体系，包括特色疗法治疗慢性肾功能衰竭、中西医结合治疗肾病综合征、综合手段治疗泌尿系结石、中西医结合治疗尿路感染等。
5、老年病科
济南市中西医结合医院老年病科，是济南市临床重点专科。科室设备齐全，病房配备有气压式高频振荡排痰系统、高流量呼吸湿化治疗仪、除颤监测仪、呼吸机等先进仪器设备。开展冠心病、心衰、心律失常、糖尿病及其并发症、高血压、脑血管病后遗症等疾病的中西医结合诊治、康复及预防工作。
