云南呼吸内科医院排名比较靠前的是昆明医科大学第一附属医院、昆明医科大学第二附属医院、解放军联勤保障部九二零医院。
昆明医科大学第一附属医院呼吸与危重症医学科是云南省首个呼吸专科，疑难危重症诊治水平省内领先。昆明医科大学第二附属医院呼吸内科亚专科齐全，睡眠呼吸疾病与内镜介入技术优势突出。解放军联勤保障部九二零医院呼吸内科设备先进，气道介入与肺部肿瘤诊疗颇具特色。
1.昆明医科大学第一附属医院 呼吸与危重症医学科
昆明医科大学第一附属医院呼吸与危重症医学科是云南省独立建科的首个呼吸专科，为省级临床重点专科及呼吸疾病研究中心，是全国首批PCCM优秀单位与专培基地。科室在省内率先构建气道支架置入、硬质支气管镜等技术体系，擅长呼吸危重症、肺癌精准诊疗及间质性肺疾病诊治，获云南省科技进步二等奖等多项奖励，承担国家级省级课题30余项，发表SCI论文30余篇，学科骨干人才众多，获多项省级集体荣誉。
2.昆明医科大学第二附属医院 呼吸内科
昆明医科大学第二附属医院呼吸内科设两个病区，拥有云南省睡眠呼吸紊乱疾病研究中心，为国家级专培基地。科室在慢性气道疾病、睡眠呼吸障碍、呼吸危重症及肺部肿瘤诊疗上省内领先，开展超声支气管镜、ECMO支持、大容量全肺灌洗等先进技术，承担国家自然科学基金等多项课题，发表SCI论文近10篇，获云南省科技进步三等奖，同时承担大量教学与基层培训任务，护理康复特色鲜明。
3.解放军联勤保障部九二零医院 呼吸内科
解放军联勤保障部九二零医院呼吸内科是多所高校硕士研究生联合培养点，拥有西南地区唯一全套肺功能测定仪等先进设备，在省内率先开展气管支气管内支架置入术。科室擅长慢阻肺、哮喘、肺部肿瘤的规范化诊疗，开展过敏原检测与脱敏治疗，近五年发表学术论文百余篇，获省部级科技成果奖9项，承担多项省及军区科研课题，多次获评先进科室，综合诊疗实力省内知名。
4.云南省第一人民医院 呼吸内科
云南省第一人民医院呼吸内科是云南省唯一临床呼吸重点专科，获评云南省呼吸疾病诊治中心。科室配备完善的RICU及各类专科检查室，在慢阻肺、哮喘、肺间质疾病、肺癌等疾病诊治上达国内先进水平，拥有完善的呼吸危重症抢救体系，年开展大量机械通气救治，获多项省及卫生厅科技进步奖，出版专业专著，是省内重要的临床、教学与进修培训基地。
5.云南大学附属医院 呼吸内科
云南大学附属医院呼吸内科建立了科学规范的呼吸系统疾病诊疗体系，在慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘、弥漫性肺间质疾病、肺癌、呼吸衰竭及胸膜疾病等常见病、危重症和疑难病的诊治方面达到国内先进水平，能为患者提供专业、规范的个体化诊疗方案，专科诊疗能力稳定可靠。
