南京痛风医院排名第一的医院是南京鼓楼医院，可就诊于风湿免疫科，南京鼓楼医院风湿免疫科在复旦版专科声誉榜中排名第四，是国家临床重点专科。此外，南京痛风医院排名比较好的还有南京医科大学第一附属医院、东南大学附属中大医院，前者的风湿免疫科是省内最早成立的风湿免疫病专科之一，救治水平居省内乃至全国领先；后者的风湿免疫科在江苏省及华东地区具有较高知名度。
第一名：南京鼓楼医院-风湿免疫科
南京鼓楼医院风湿免疫科是国家临床重点专科、江苏省科教兴卫重点学科、江苏省临床重点专科、江苏省风湿免疫疾病诊疗中心。在复旦大学中国医院最佳专科声誉排行榜中排名第四，2019年攀升至并列第三，2019年度中国医院科技值（STEM）风湿病学与自体免疫病学排名第三。可诊治痛风、类风湿关节炎、强直性脊柱炎等疾病。
第二名：南京医科大学第一附属医院-风湿免疫科
南京医科大学第一附属医院风湿免疫科是江苏省临床重点专科、国家风湿免疫专业临床药理基地，是省内最早成立的风湿免疫病专科之一，是著名风湿病学专科。科室临床实力雄厚，擅长诊治痛风等各类风湿免疫疾病，尤其在疑难及危重风湿免疫病救治方面有丰富经验，救治水平居省内乃至全国领先。
第三名：东南大学附属中大医院-风湿免疫科
东南大学附属中大医院风湿免疫科，已发展为学术梯队健全，治疗手段齐全，设施配套完善，在江苏省及华东地区具有较高知名度的风湿免疫病专科。诊治病种主要为痛风等风湿免疫性疾病、变态反应性疾病和继发性骨质疏松等。下设免疫实验室，能开展多种自身抗体、细胞表面标志、细胞因子等免疫指标的检测及进行临床、基础试验研究，为风湿免疫性疾病的早期诊断、早期治疗提供依据。
第四名：东部战区总医院-风湿免疫科
东部战区总医院风湿免疫科成立以来，成功申请2020年后勤科研计划一项，经费75万。2021年科室还获得江苏省医学科技奖一项。科室发表SCI论文3篇，中文两篇。多年来在“痛风”、“自身炎症性疾病”和“变态反应病”等方面具有一定特色。
第五名：南京市第一医院-风湿免疫科
南京市第一医院风湿免疫科为南京市临床重点专科，南京医科大学风湿免疫专业硕士学位授予点。常规收治各类关节炎及系统性结缔组织病患者，尤其对于重症红斑狼疮、干燥综合征、难治性类风湿性关节炎、强直性脊柱炎及痛风等疾病的诊治积累了丰富的经验。
第六名：南京市第二医院-风湿免疫科
南京市第二医院风湿免疫科，是医院发展的临床特色科室。主要承担治疗各类免疫性疾病，尤其是伴有肝功能损害的各类免疫性疾病，如自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、痛风、干燥综合征、系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、强直性脊柱炎等。
第七名：江苏省中西医结合医院-风湿免疫科
江苏省中西医结合医院风湿免疫科，承担着临床工作及南京医科大学和南京中医药大学临床实习和临床教学工作。科室突出中西医结合的特色，采取系列中药，序贯治疗，形成个体化治疗方案，配合中医疗法如中药热庵包、耳穴疗法、艾灸、中药熏洗等，对痛风、风湿性关节炎等病人治疗疗效的提高。
第八名：南京医科大学附属江宁医院-风湿免疫科
南京医科大学附属江宁医院风湿免疫科成立于2008年，收治类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、痛风、干燥综合征、强直性脊柱炎等风湿免疫科常见病，并收治贝赫切特综合征、成人Still病、SAPHO综合征等罕见病病种。开展了包括抗核抗体、免疫球蛋白、抗CCP抗体、抗中性粒细胞胞浆抗体、唇腺活检术、关节腔穿刺注射术、关节滑液分析、腮腺MRI等。
第九名：中国医学科学院皮肤病医院-过敏与风湿免疫科
中国医学科学院皮肤病医院过敏与风湿免疫科主要开展过敏性疾病和自身免疫性疾病的诊断和治疗。科室在红斑狼疮、皮肌炎、痛风、硬皮病、血管炎及银屑病关节炎等自身免疫性疾病的诊断和治疗方面均具有丰富的经验。开展的特色检测项目包括过敏原特异性检测、自体血清皮肤试验、冰贴试验、振动试验等。
第十名：南京医科大学附属逸夫医院-风湿免疫科
南京医科大学附属逸夫医院风湿免疫科，拥有从事内科及风湿病专科工作30余年的主任医师，擅长各类风湿免疫病的诊治。尤其在种弥漫性结缔组织疾病如多发性肌炎皮肌炎、系统性红斑狼疮、干燥综合症，类风湿关节炎、强直性脊拄炎、痛风性关节炎、疑难及危重风湿免疫病救治方面有丰富的临床经验。