广州肺结核专科医院在广州市胸科医院、南方医科大学南方医院、广州医科大学附属第一医院等。广州市胸科医院结核科是广州市高水平临床重点专科建设项目，下设肺结核科、肺外结核科等；南方医科大学南方医院感染内科学科地位、综合实力位居全国领先水平；广州医科大学附属第一医院感染内科是广东省临床重点专科，学科实力在省内处于领先地位。
第一名：广州市胸科医院-结核科
广州市胸科医院结核科，是广州市高水平临床重点专科建设项目和广州市重点学科建设项目，是该院重点专科，肩负着广州地区抗击世纪结核病的重责。下设肺结核科、重症结核科、肺外结核科、结核儿科、结核外科、结核病控制管理科等多个结核病亚学科，尤其对重症、难治性肺结核及其并发症的治疗、顽固性咯血的介入治疗，难治性气胸、结核性毁损肺、复杂性支气管胸膜瘘、耐多药结核、骨结核、小儿结核、结核性脑膜炎以及非结核分枝杆菌疾病的治疗等专科疾病具有较高的医疗、科研水平。
第二名：南方医科大学南方医院-感染内科
南方医科大学南方医院感染内科目前已成为集医疗、教学、科研、预防于一体的传染病与肝病临床与转化医学平台，长期承担国家传染病防治、保健、医学人才培养和科学研究的重要任务，学科地位、综合实力位居全国领先水平，医疗服务立足华南、面向全国、辐射东南亚乃至世界各国。
第三名：广州医科大学附属第一医院-感染内科
广州医科大学附属第一医院感染内科是广东省临床重点专科，是目前广东地区综合性医院同类学科中，规模较大的临床医疗科室之一。2017年进入广东省最强科室肝病/感染科前10位。科室积累了丰富的临床经验。医疗服务立足广州，辐射全国。学科实力在省内处于领先地位。
第四名：广东省人民医院-感染科
广东省人民医院感染科，是广东省临床重点专科、广东省医学特色专科、国家药物临床试验基地、卫生部临床药师培训基地、肝病、传染病专业硕士研究生授予点，现已发展成为省内领先、国内先进的临床学科，是华南地区重要的感染病中心之一。感染科拥有多个亚专科，每年收治各种感染疾病和肝病患者，在慢乙肝及相关性肝癌的生物免疫治疗、肝硬化、肝功能衰竭、不明原因发热、疑难感染等方面具备多项国内领先的特色优势。
第五名：中山大学附属第三医院-感染性疾病科
中山大学附属第三医院感染性疾病科是我国最早成立的传染病学教研室之一，先后获得国家临床重点专科、国家感染性疾病专业新药临床试验基地、热带病防治研究教育部重点实验室、广东省重点专科、广东省传染科质量控制中心组长单位等，现已成为我国南方传染病学专业重要的教学、医疗、科学研究与人才培养的基地。感染性疾病科现有7个病区、感染科门诊及感染科实验室。感染科多年来积极开展重症肝炎治疗的新技术、新疗法。
第六名：中山大学孙逸仙纪念医院-感染科
中山大学孙逸仙纪念医院感染科，是国家规划教材、卫生部五年制高等医学院校教材《传染病学》的编写单位之一，科室擅长病毒性肝炎、肝硬化、肝癌等肝病，伤寒、出血热、菌痢、恙虫病、艾滋病等感染性疾病及华支睾吸虫病等各种寄生虫病，未明原因发热等的诊治与研究，尤擅疑难危重传染病及寄生虫病的抢救治疗工作。
第七名：南方医科大学珠江医院-感染疾病科
南方医科大学珠江医院感染疾病科，开设肝病门诊、发热门诊、肠道门诊等特色门诊，是广州市医保局“慢性乙型、丙型病毒性肝炎”医保门诊特定项目的指定诊疗科室。感染疾病科主持及参与多项国家及省、市、区级科研课题项目。承担医学本科生、研究生的传染病学及抗菌药物合理使用的教学任务，开展PBL教学实践；承担进修医师、住院医师规范化培训医师的培养指导工作。
第八名：广州医科大学附属第二医院-感染病科
广州医科大学附属第二医院感染病科，在感染性疾病的诊断和治疗水平上均走在同类医院科室的前列。感染病科积极开展科研工作，承担省、省厅、市局和学院及医院科研项目，每年均有多篇科研论文在国家级和省级杂志上刊登。重视人才培养，坚持在职医师继续教育，不断提高医疗水平和创新能力，为广东省首批传染病科住院医师规范化培训基地之一。
第九名：广州市第一人民医院-感染科
广州市第一人民医院感染科现开设：肝病门诊（乙肝专科、丙肝专科、肝吸虫专科）、肠道门诊（肠道专科）、发热门诊。承担及联合承担国家、省和市级等多类科研项目。主要诊治的疾病与特色包括肺结核、急慢性乙型或丙型病毒性肝炎及肝硬化；各种原因引起的黄疸、肝脾肿大、肝功能异常等；各种病毒感染性疾病：如急性上呼吸道感染、流行性感冒、麻疹、水痘等；各种寄生虫感染性疾病：如肝吸虫病、绦虫病、囊虫病、疟疾、阿米巴病等。