北京小儿神经内科医院排名靠前的是首都医科大学附属北京儿童医院、北京大学第一医院、首都儿科研究所附属儿童医院。首都医科大学附属北京儿童医院国内小儿神经内科发源地之一，综合实力国际先进。北京大学第一医院国内首个儿科神经专业组，学科水平全国领跑，专家学术影响力辐射国际。首都儿科研究所附属儿童医院设专属神经重症监护病房，多学科协作开展前沿神经诊疗技术。
1.首都医科大学附属北京儿童医院 神经内科
该科获批中国SMA诊治中心联盟、全国脑炎专业诊疗中心，挂牌全国三级综合癫痫中心及脑电图培训基地，擅长罕见病、疑难危重症及癫痫等各类儿童神经系统疾病诊治。科研连续入围神经病学STEM排行榜，主持数十项国家级、省部级课题；
2.北京大学第一医院 小儿神经内科
北京大学第一医院 小儿神经内科成立国内首个儿科神经专业组，学科水平全国领先。多位专家担任国内外重要学术团体领导职务，率先开展24小时动态脑电图、视频脑电图监测，建立有机酸代谢病、神经遗传病筛查诊断及产前诊断体系，打造了现代化神经发育与康复诊疗体系。
3.首都儿科研究所附属儿童医院 神经内科
设神经重症监护病房，开设神经感染免疫、癫痫、神经遗传代谢等多个亚专业，与神经外科合作开展立体定向脑电图、术中神经电生理监测等前沿技术。开设癫痫、肌无力专病门诊，可开展多导睡眠监测、表面肌电图等特色检查。承担北京市儿科住院医师规范化培训及高校教学任务，主持科技部、国家自然科学基金等多项课题。
4.北京协和医院 儿科
为中国现代儿科发祥地，依托协和医院全国疑难重症诊治指导中心的综合优势，在与小儿神经相关的儿科遗传病、罕见病诊治方面国内享誉盛名。设七大专业组，各专业诊疗水平始终保持行业顶尖，为大量神经相关疑难罕见病患儿明确诊断并制定精准方案，多次斩获各级医疗科研成果奖励。
5.中国人民解放军总医院 小儿内科
设神经与康复专科，打造儿童神经疾病诊疗与功能康复一体化模式，对癫痫、中枢神经系统感染、神经免疫性疾病、脑血管病等诊治在国内外享有高声誉，开展儿童脑瘫规范化康复治疗。科研上主持国家863计划、自然科学基金等多项课题，获宋庆龄儿科医学奖、中华医学科技奖等多项大奖。
