合肥消化内科比较好的医院是安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院、安徽医科大学第二附属医院，安徽医科大学第一附属医院消化内科是十四五”安徽省临床优先发展重点学科，是目前国内面积最大的消化内镜中心，能够开展国家重点专科所要求的全部诊疗项目。安徽省立医院消化内科在某些方面已达到国内先进和省内领先水平，安徽医科大学第二附属医院消化内科是临床特色专科及首批重点扶持学科。
第一名：安徽医科大学第一附属医院-消化内科
安徽医科大学第一附属医院的消化内科，是“十四五”安徽省临床优先发展重点学科，安徽省高校重点学科。学科由四个病区、两个内镜中心、专科门诊及省级消化病重点实验室组成，是目前国内面积最大的消化内镜中心，内镜中心设施齐全，医疗设备先进，能够开展国家重点专科所要求的全部诊疗项目。
第二名：安徽省立医院-消化内科
安徽省立医院的消化内科是安徽省临床重点培育学科，省内率先开展内镜下大黏膜切除/剥离/挖除术、内镜隧道及肌切开技术、染色放大内镜技术。经内镜下食管胃肠早癌、癌前期病变、消化道黏膜下肿瘤、贲门失迟缓症等微创治疗，例数系省内最多。达到省内领先水平。积极开展消化疾病临床与基础研究，在某些方面已达到国内先进和省内领先水平。
第三名：安徽医科大学第二附属医院-消化内科
安徽医科大学第二附属医院的消化内科，是临床特色专科及首批重点扶持学科，由消化专科病区以及消化内镜诊疗中心组成，可开展常规胃肠镜、无痛胃肠镜、超声内镜、十二指肠镜、胆胰内镜等检查与治疗。建科以来多次被评为“优质服务科室”和“效益贡献奖”。
第四名：合肥市第一人民医院-消化内科
合肥市第一人民医院的消化内科属医院一级独立学科，是合肥市第四周期及第五周期重点专科、安徽省十三五重点培育专科；合肥市首届胃肠疾病名医工作室。开展了包括食管、胃、肝脏、胆胰、肠道及肛管等各种消化系统常见病、多发病的专科和内镜综合诊断及治疗。
第五名：合肥市第二人民医院-消化内科
合肥市第二人民医院的消化内科是院重点学科，在临床、科研、医疗设备及学术地位上处于合肥市级医院领先地位，部分技术达到省级先进水平。科室独立开展多项临床技术，如消化道出血急诊止血、异物取出术，放大染色内镜早期胃肠癌筛查，内镜下早期消化道癌及胃肠道息肉EMR、ESD术，消化道狭窄内镜下扩张术等。
第六名：安徽省第二人民医院-消化内科
安徽省第二人民医院消化内科是我院重点学科，科室先后派出多名医生赴北京301医院、上海瑞金医院、上海长海医院、上海仁济医院、西京医院、南京鼓楼医院等国内大型医院进修学习。2018年科室获批省级科研项目两项。2020年申报科研立项2项,2021年获安徽省第六批卫生健康适宜技术推广项目1项。
第七名：安徽医科大学第一附属医院北区-消化内科
安徽医科大学第一附属医院北区的消化内科，设有消化内科病区以及消化内镜诊疗中心，常规开展普通及无痛苦胃肠镜检查、超声内镜检查，消化道良恶性肿瘤内镜下治疗EMR、ESD、食管胃底静脉曲张内镜治疗、胆胰ERCP等操作。已开展P0ME、TIPS等特殊手术。设立特色亚专科，在肠衰竭治疗、营养治疗以及重症胰腺炎治疗方面更是处在省级领先水平。
第八名：合肥市第三人民医院-消化内科
合肥市第三人民医院的消化内科是医院重点扶持学科，全面开展消化系统疾病的诊治工作，尤其在胃食管反流病、慢性胃炎、消化性溃疡及HP感染、炎症性肠病、药物性肝病、肝硬化顽固性腹水等疾病治疗上有独特的疗效，对肝性脑病，上消化道大出血，重症急性胰腺炎等危重病例的抢救十分有效。