福建呼吸科医院排名靠前的是福建医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科、福建医科大学附属协和医院呼吸科、福建省立医院呼吸内科等。福建医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科是国家首批PCCM规范化建设三级医院优秀单位，连续6年荣获复旦专科声誉排行榜（华东区）提名，睡眠呼吸障碍性疾病等多类疾病诊疗水平位列省内前茅；福建医科大学附属协和医院呼吸科是国家级、省级临床重点专科老年医学科的重要成员，配备磁导航支气管镜等先进诊疗设备，可开展全层级呼吸介入操作；福建省立医院呼吸内科是委省共建国家呼吸区域医疗中心，近年多次荣获复旦专科声誉排行榜华东区呼吸专业提名，2022年度中国医科院医院STEM排行榜位列第27名。
1、福建医科大学附属第一医院 呼吸与危重症医学科
福建医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科是国家卫健委首批PCCM专科医师规范化培训基地、省级临床重点专科，也是国家呼吸临床研究中心核心单位、福建省睡眠呼吸疾病诊治中心挂靠单位，同时为国家药物/器械临床试验专业机构。科室现有主任医师3人、副主任医师7人，博士生导师3人、硕士生导师8人，开放床位117张，其中呼吸重症监护病房（RICU）15张，下设肺功能室、支气管镜室等功能区，开设肺小结节多学科诊疗及睡眠呼吸疾病、肺血管疾病等专病门诊。科研层面先后承担国家自然科学基金项目12项、各级科研项目30余项，发表论文300余篇，其中SCI收录70余篇，获福建省科技进步奖二等奖2项、三等奖2项，福建医学科技奖二等奖6项。
2、福建医科大学附属协和医院 呼吸科
福建医科大学附属协和医院呼吸科是国家级、省级临床重点专科老年医学科的重要成员，也是医院第五批重点学科建设项目培育学科。科室现有医护技人员50余人，其中博士生导师2名、硕士生导师7名，主任医师5名、副主任医师3名，博士3名、硕士18名，开放于山院区床位69张、旗山院区床位30张，设肺功能室、睡眠呼吸监测室等功能区，配备MS--Diffusion肺功能仪、磁导航支气管镜等先进设备，可开展支气管单向活瓣植入、气道支架植入等多项4级呼吸介入手术。近年承担多项国家级、省级科研项目，发表SCI论文20余篇，学科成员曾获福建医学科技奖、福建省科学进步奖、中华医学科技奖，参与制定多部国家级指南、共识。
3、福建省立医院 呼吸内科
福建省立医院呼吸内科是国家临床重点专科建设单位、委省共建国家呼吸区域医疗中心、福建省呼吸医学中心，也是首批国家PCCM专培基地、国家药物临床试验机构（呼吸专业）、全国间质性肺疾病规范诊疗中心优秀单位。科室设东街、金山两个院区，开放普通病房床位130张、RICU床位20张，配有呼吸内镜中心、肺功能管理中心等功能区；现有医师31人、护士98人，高级职称14人，博/硕士学位占比70%以上，博/硕士研究生导师7人，多位专家担任《中华结核和呼吸杂志》等国家级核心期刊编委。科室参与制定10余部国家级专科诊疗指南或专家共识，承担多项国家科技重大专项、国家自然科学基金项目，发表SCI论文50余篇，含《新英格兰医学杂志》《CellResearch》等顶刊成果。
4、厦门大学附属第一医院 呼吸内科
厦门大学附属第一医院呼吸内科是福建省内建制最早的呼吸专科之一，也是厦门市唯一获评国家呼吸内科规范化建设三级医院优秀单位的科室，为闽西南地区呼吸疾病诊治和研究中心。科室现有床位98张，其中重症监护床位18张；有专科医师19名、护士40名、呼吸治疗师3名、肺功能技师3名，其中硕士生导师4名，主任医师6名、副主任医师7名，医师队伍医学博士6名、硕士占比90%以上，近3年派送9名青年骨干赴国内外高水平研究中心进修。近年承担和参与国家、省、市级科研计划20余项，发表学术论文100余篇，其中SCI论文20余篇，获国家发明专利4项、厦门市科技进步一等奖1项，2017年中国医学科学院科技影响力排名升至全省第一。
5、福建医科大学附属第二医院 呼吸与危重症医学科
福建医科大学附属第二医院呼吸与危重症医学科是国家临床重点专科、福建省呼吸医学中心，也是国家卫计委首批PCCM专科医师规范化培训基地、中国医师协会首批呼吸内镜培训基地，通过国家GCP专业认证，为国家呼吸临床研究中心核心单位。科室现有主任医师3人、副主任医师5人，博士生导师1人、硕士生导师4人，留学回国人员3人，博士7人、硕士14人；有100余人次在各类学术组织任职，其中国际学术组织1人次、全国性学术组织55人次。学科介入呼吸病学亚专科达国内先进水平，创新开展球囊探查加选择性支气管封堵术治疗难治性气胸并在国内20余家三甲医院推广；近年获国家重点研发计划立项，发表SCI论文50余篇，获省部级科技二等奖5项、专利20余项。
