乌鲁木齐耳鼻喉科好的医院有新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆医科大学第二附属医院等。新疆维吾尔自治区人民医院耳鼻喉诊疗中心，在全疆的耳鼻喉诊疗中心处于龙头地位；新疆医科大学第一附属医院耳鼻喉科，拥有先进的医疗设备，并广泛开展世界上最先进的鼻内窥镜外科手术；新疆医科大学第二附属医院耳鼻喉科，系自治区内建立最早的耳鼻喉专科之一。
第一名：新疆维吾尔自治区人民医院-耳鼻喉诊疗中心
新疆维吾尔自治区人民医院耳鼻喉诊疗中心，是一个团结进取，求真务实，技术过硬的优秀集体，在新课题、新业务、新技术方面得以迅速发展，在全疆的耳鼻喉诊疗中心处于龙头地位，尤其是听力学检查、鼻窦内窥镜及喉显微外科的诊治方面，在头颈肿瘤的综合治疗、小耳畸形的整形手术方面处于领先水平。
第二名：新疆医科大学第一附属医院-耳鼻喉科
新疆医科大学第一附属医院耳鼻喉科，拥有先进的成套的医疗设备，如美国数字化stryker1088鼻内窥镜手术系统、德国Storze耳、喉、气管及支气管内窥镜成像系统等。耳鼻咽喉科除开展了本科常见病、多发病及各类急、重、难、疑病症的诊治外，目前世界上最先进的鼻内窥镜外科手术在该科广泛开展，应用范围不断扩大，不仅涉及鼻窦炎鼻息肉也包括鼻窦真菌病，鼻窦囊肿，鼻内翻性乳头状瘤，鼻咽部纤维血管瘤及增殖体肥大，泪囊鼻腔造孔术等。
第三名：新疆医科大学第二附属医院-耳鼻喉科
新疆医科大学第二附属医院耳鼻喉科，系自治区内建立最早的耳鼻喉专科之一，新疆耳聋防治及听力重建中心，医院的重点科室之一。科室内的内植法修补鼓膜穿孔、闭式乳突手术加鼓膜式成形术，均达到了国内先进水平，居区内领先水平，分别获得自治区科技成果二等奖、三等奖。
第四名：新疆医科大学第五附属医院-耳鼻咽喉-头颈外科
新疆医科大学第五附属医院耳鼻咽喉-头颈外科，是一个集临床、教学、科研为一体的综合科室，科室在耳鼻咽喉头颈的常见病、多发病、疑难病的诊疗方面积累了丰富的临床经验，尤其是中-重度常年性变应性鼻炎在药物治疗无效后采用鼻内镜翼管神经切断术取得良好的效果。科室注重精神文明和职业道德建设，获得2018年校级巾帼文明岗、优质护理科室，2018年、2019年院级先进科室。
第五名：新疆生产建设兵团总医院-耳鼻喉科
新疆生产建设兵团耳鼻喉科，拥有先进的设备以及专业的人员，运用电子鼻咽喉镜及鼻内镜、耳内镜等进行检查诊断，可开展多种微创手术，例如喉癌手术、颜面恶性肿瘤切除并皮瓣转移等疑难手术，对耳性眩晕的诊断及治疗已达自治区先进水平。
第六名：乌鲁木齐市友谊医院-耳鼻喉科
乌鲁木齐市友谊医院耳鼻喉科，能对耳鼻喉科的常见病、多发病及疑难病、少见病提供正确的诊断及治疗，开展常规手术。尤其在喉息肉的手术及术后病人康复过程中，充分发挥西医手术治疗的基础上结合中医中草药，形成科室的特色治疗。
第七名：新疆军区总医院北京路临床部-耳鼻咽喉科
新疆军区总医院北京路临床部耳鼻咽喉科，拥有先进的医疗设备，能开展耳鼻咽喉科各类手术和治疗，尤其在中耳显微手术、鼻窦内窥镜手术、显微支撑喉镜手术等方面有较强实力，科室内的电子纤维鼻咽喉镜是目前国内最新设备，具有痛苦少，早期诊断率高的特点。