南京双向障碍科医院排名比较靠前的是南京脑科医院、南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院。
南京脑科医院精神大科是国家临床重点专科，华东领先，亚专科与技术体系最齐全。南京医科大学第一附属医院临床心理科是江苏省综合医院最早建立的临床心理科，诊疗全面，教学科研扎实。南京鼓楼医院医学心理科是学科带头人学术地位高，诊疗范围广，药物联合心理治疗成熟规范。
1.南京脑科医院 精神大科
南京脑科医院精神大科学科特色鲜明，擅长精神分裂症早期干预、抑郁症综合治疗、危机干预、儿童青少年心理健康干预，同时可规范诊治双相情感障碍，医学心理门诊量居全国前列，还是全国重要的精神病司法鉴定中心之一，医疗技术达全国先进水平，在2018年度中国医院精神医学专科排行榜中位列第六、华东区前两位。
2.南京医科大学第一附属医院 临床心理科
南京医科大学第一附属医院临床心理科是省内综合性医院中最早建立的同类科室，获江苏省医学重点专科称号，在临床诊疗、教学科研方面成果显著。
科室擅长各类情绪问题、神经症、躯体疾病合并的心理问题及婚恋、学业、工作等相关心理困扰的诊治，可开展双相情感障碍的综合干预，采用心理评估、疏导与药物治疗相结合的方式，同时承担多所院校的医学心理学相关教学任务，主编多部相关教材，承担多项科研项目。
3.南京鼓楼医院 医学心理科
南京鼓楼医院医学心理科是多所高校的教学实习基地，学科带头人曹秋云主任医师学术地位突出，担任多个省级学术委员会重要职务并获多项学术奖项，科室获评南京市医学重点专科。
科室擅长抑郁症、焦虑症、失眠症等多种心理精神疾病的诊治，尤其在双相情感障碍的心境稳定剂规范使用及心理干预方面颇具优势，采用生物、心理、社会相结合的治疗模式，以药物与心理治疗结合为特色，为江苏省及周边省市提供优质心理卫生服务，诊疗范围涵盖各类心理障碍及心身疾病。
4.东南大学附属中大医院心理咨询科
东南大学附属中大医院心理咨询科是江苏省首家综合性医院设立的精神卫生专科，获江苏省临床重点专科（培育）称号，开设心身医学诊疗中心及多个专业诊疗组。
科室较早引进经颅磁刺激治疗技术，是南京地区首家设立睡眠监测室的相关专科，擅长双相情感障碍的全程规范化诊疗，诊疗优势显著。学科承担多项国家省部级科研项目，发表大量高质量论著，斩获多项各级科技奖项，形成了“立足精神卫生、面向综合科室、拓展心身医学”的特色发展模式，还与国外高校联合成立临床研究中心。
5.东部战区总医院 心理咨询科
东部战区总医院心理咨询科诊疗经验丰富，是军队心理卫生服务示范单位，科室在躯体形式障碍、抑郁症、焦虑症、强迫症的诊治方面具有显著优势，擅长双相情感障碍的鉴别诊断与个体化治疗，同时擅长青少年心理、婚姻家庭问题、适应障碍及失眠等相关心理问题的干预，能够精准应对心理咨询科常见病、多发病及疑难病，为患者提供专业诊疗服务。
