杭州市第一人民医院擅长呼吸与危重症医学科、消化内科、神经内科、心血管内科、骨科。上述科室高端人才荟萃、技术实力雄厚、医疗设施一流，患者可根据个人情况就诊。
1、呼吸与危重症医学科
目前已成为集医疗、教学、科研于一体的综合型呼吸疾病的诊疗科室，近年来在慢性阻塞性肺病、呼吸衰竭、肺部感染、支气管哮喘、肺癌等呼吸系统常见疾病诊治方面积累了丰富的经验，并显示出自己的独到之处。
2、消化内科
是浙江省医学重点扶持学科、杭州市医学I类重点学科，在消化内镜治疗胆胰和胃肠道疾病具有极大的优势，深受国内同行专家认可，特别是EUS联合ERCP治疗胆道系统结石、慢性胰腺炎、胆胰恶性肿瘤等胆胰疾病处于国内领先地位。
3、神经内科
是杭州市卫生局重点专科，在省内有较高的知名度，学科水平位于省内先进，尤其在脑血管病诊治方面处于省内领先水平，是杭州地区的骨干学科。同时科室在癫痫、帕金森病等神经科常见病、多发病诊治方面有自己的特色，在神经科及相关学科的疑难、重危病人的诊治方面也有很高水准。
4、心血管内科
是浙江省医学重点扶植学科、杭州市一类医学重点学科，先后成为中国胸痛中心、房颤中心等认证单位，并以此为依托推动了区域内及基层各中心的建设和心血管学科的发展。同时科室是全国最早开展房颤冷冻消融术的中心之一，年手术量及成功率均位于全省乃至全国前列。
5、骨科
是浙江省医学重点学科、杭州市重点学科，科室在创伤、骨关节病、运动医学、脊柱疾患、骨肿瘤的治疗上拥有丰富的经验，在杭州地区及省内享有很高的声誉，门诊量居杭州地区各医院前列，手术量在杭州市属医院中名列前茅。