宝鸡市人民医院擅长的科室有心血管内科、神经内科、创伤整形美容科、泌尿外科、眼科等，这些科室设备齐全、技术力量雄厚，可以为患者提供高水平的治疗。
1、心血管内科
宝鸡市人民医院心血管内科成立于1996年，是市医学重点专科，也是宝鸡市成立最早的心血管病诊治专科。配有中心监护站、呼吸机、除颤仪、食道调搏仪、24小时动态心电图检测仪、各种起搏器程控仪、临时起搏器等设备。开展的冠状动脉造影及支架植入术、临时起搏器及永久起搏器植入术、三腔起搏器植入术、心脏埋藏式复律除颤植入、射频消融术、先天性心脏病封堵术、大动脉支架植入术、食道调搏术、顽固性高血压病诊治等处于领先水平。
2、神经内科
宝鸡市人民医院神经内科是市医学重点专科，分为神经内一科、神经内二科、神经内三科。其中神经内一科是国家级卒中中心、北京天坛神经介入联盟成员单位，并成立癫痫诊疗中心。神经内二科先后被授予“国家神经系统疾病临床医学研究中心-神经免疫与感染疾病研究分中心”、“陕西省认知障碍疑难病例会诊中心”、“陕西省睡眠医学联盟成员单位”、“陕西省脑血管病专科神经介入联盟”成员单位。神经内三科（脑血管介入科）是国家级卒中中心建设单位，处于本地区领先地位。
3、创伤整形美容科
宝鸡市人民医院创伤整形美容科成立于1998年，是宝鸡市较早成立的专业整形美容科室。现已形成美容外科、颜面创伤修复、瘢痕及体表肿瘤诊治、创面修复、毛发移植及微整形（激光、注射）等多个特色诊疗组，成为集临床、科研、教学为一体的宝鸡市重点专科。
4、泌尿外科
宝鸡市人民医院泌尿外科目前是宝鸡地区规模最大、分科齐全的集医疗、教学、科研、保健为一体的现代化多功能的泌尿专科病院，为陕西省临床重点专科、全国青年文明号集体、宝鸡市重点专科、宝鸡市泌尿外科质量控制中心、宝鸡市医学会泌尿外科主委单位。科室分设泌尿系结石、泌尿系肿瘤、男科、前列腺疾病、尿控、普通泌尿外科、小儿泌尿外科、肾内科、慢性肾脏病管控等亚专业。
5、眼科
宝鸡市人民医院眼科为省级重点专科、市级医学重点专科，经过五十多年的发展，已成为集医疗、教学、科研、防盲为一体，在本地区享有盛誉的眼病诊疗中心。年门诊量50000余人次，出院患者2300余人次，手术2100余人次。年开展准分子激光矫治近视1000余人次。
