大连市第三人民医院擅长肿瘤科、眼科、普通外科、心内科、神经内科。上述科室学科综合实力领先，临床专科诊治优势突出，能够为患者提供优质的医疗服务。
1、肿瘤科
大连市第三人民医院肿瘤科是全市建立最早的肿瘤专科，评为市一级重点学科以来, 医疗技术水平不断提高，肿瘤专科的地位已经逐步确立。学科逐年发展扩大，医疗设备不断更新，在肿瘤的诊治方面形成了一定的规模、实力，有了相当的影响力。在大肠癌、胃癌、恶性淋巴瘤的诊治方面形成了一套科学的、独具专科特色的综合治疗方案，在实施中取得了满意的临床疗效，治疗水平居国内先进地位。
2、眼科
大连市第三人民医院眼科是市一级医学重点学科，擅长诊治各种疑难眼病，在国内率先引进开展眼科显微手术及眼底荧光造影、白内障摘除暨人工晶体植入等先进的眼科诊断治疗技术。做为大连市各大医院眼科中唯一的市一级医学重点学科的三院眼科，拥有一支分科精细、梯队合理的专业技术队伍，配有齐全的现代化诊治设备，诊治各类眼科疑难病症的准确率、成功率、治愈率均居全国先进水平。
3、普通外科
大连市第三人民医院普通外科是以腹部肿瘤诊治为主的临床科室，技术力量雄厚。具有高级职称人员均在国内著名肿瘤专科医院接受过严格的专业培训，手术技巧娴熟，并有多年的肿瘤外科临床经验。开展以消化道肿瘤为主的手术治疗，包括胃肠道肿瘤、肝脏肿瘤、胆道肿瘤、胰腺肿瘤等。科室每年发表学术论文数篇，并承担多所大专院校的实习教学任务。
4、心内科
大连市第三人民医院心内科近年来学科规模不断扩大，学术地位与医疗水平不断提升，拥有一支高水平、高学历、作风严谨的技术团队，评为大连市二级重点学科，并成立胸痛中心、心脏康复中心，现为国家标准化心脏康复中心建设单位。诊疗范围包括高血压、冠心病、心力衰竭、心律失常、心肌病等，并拥有冠心病介入诊疗技术、心脏起搏器治疗技术、心律失常射频消融技术等技术特色。
5、神经内科
大连市第三人民医院神经内科是大连市一级重点专科，具有很强的技术实力，拥有先进的检查治疗仪器，为临床正确诊断、及时治疗提供了坚实的基础，其中开展脑梗死超早期爱通力及尿激酶的溶栓治疗，积累病例数百例，具有丰富的临床经验，成功的挽救了多名患者的生命，减少神经功能的缺损，受到患者及同行专家的高度赞誉。同时对于神经内科的多种疾病、多发病，如脑梗死、脑出血、蛛网膜下腔出血等都有着十分丰富的经验。对疑难杂症的鉴别诊断思路广泛，诊断准确性高，得到了同行的认可。