乌鲁木齐甲状腺外科医院排名比较靠前的是新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆医科大学第二附属医院。
新疆维吾尔自治区人民医院乳腺甲状腺科甲状腺微创消融与癌肿规范化诊疗特色突出。新疆医科大学第一附属医院血管甲状腺外科是新疆最早系统开展甲状腺疾病诊疗的专科。新疆医科大学第二附属医院普外科甲状腺专业技术成熟，综合诊疗实力较强。
1.新疆维吾尔自治区人民医院 乳腺、甲状腺科
新疆维吾尔自治区人民医院乳腺甲状腺科专科特色鲜明，常规开展甲状腺良恶性肿瘤、甲状旁腺疾病规范化治疗。科室广泛开展甲状腺微波消融微创术，具有创伤小、保护腺体功能等优势，同时开展腔镜及开放甲状腺癌根治术、甲状旁腺切除+自体移植术，采用MDT模式为患者制定个体化方案，诊疗效果与美容效果俱佳。
2.新疆医科大学第一附属医院 血管、甲状腺外科
新疆医科大学第一附属医院血管甲状腺外科是新疆最早开展甲状腺疾病系统诊疗与研究的专科，技术水平区域领先。科室可全面诊治甲亢、甲状腺良恶性肿瘤、甲状旁腺肿瘤等疾病，同时兼顾血管疾病诊疗，开展多项临床研究，在甲状腺手术方式优化方面成果显著，人才梯队完善，具备硕博培养能力。
3.新疆医科大学第二附属医院 普外科
新疆医科大学第二附属医院普外科为自治区临床重点建设学科，下设乳腺甲状腺专业组，技术实力雄厚。科室可开展各类甲状腺疾病常规及微创手术，依托先进腔镜设备实现微创化治疗，同时承担研究生培养与规培教学任务，主持多项自治区自然科学基金项目，诊疗安全性与疗效突出。
4.新疆医科大学第五附属医院 普外科
新疆医科大学第五附属医院普外科是综合性临床科室，常规开展甲状腺切除术等各类甲状腺手术。科室在甲状腺疾病及乳腺、肝胆、胃肠等普外疾病诊疗上经验丰富，较早开展腹腔镜微创技术，手术安全性高、并发症少，同时承担临床教学任务，在专业期刊发表多篇学术论文。
