哈尔滨市第一医院擅长的科室有耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、麻醉科、生殖中心等。
1、耳鼻喉科
哈尔滨市第一医院耳鼻喉科拥有先进的诊疗设备，一批专业的医疗护理队伍，很好的完成耳鼻喉科各种常见病、多发病的诊疗工作及各种急重症的救治工作，如急性喉梗阻、喉癌、颈部开放性外伤等方面的诊治。近年来该科与时具进，不断开发创新，开展微创手术已诊治病人千例以上，在社会上取得了良好的口碑及信誉。多年来在国家级及省级杂志共发表论文数十余篇。
2、口腔科
哈尔滨市第一医院口腔科开展各类龋病的防治、牙体牙髓病的诊断及治疗，以及牙周病、黏膜病的诊断及治疗等。其中在残根保留方面，科室做了大量的临床研究工作，尽量保留可以治疗的牙根，减少牙槽骨的吸收，为进一步完成义齿修复奠定良好基础。医生会在可能的情况下，尽量保存牙根，完成根上义齿的设计及修复。
3、皮肤科
哈尔滨市第一医院皮肤科病房是有着悠久历史的科室，近几年，新技术的开展，新仪器的引进，使皮肤科的医疗水平有了飞速的发展。主要诊治疾病包括湿疹、皮炎、玫瑰糠疹、单纯疱疹、带状疱疹、花斑糠疹、手足癣等，拥有半导体激光治疗带状疱疹、丹毒，以及液氮冷冻技术治疗各种病毒性皮肤病等技术特色。
4、麻醉科
哈尔滨市第一医院麻醉科拥有先进的医疗设备，除承担各开刀科室手术的麻醉工作外，还承担各种危重病人的抢救、麻醉工作等，同时承担哈医大、牡丹江医学院讲课实习带教任务，科研方面曾获市科技进步二等奖一项、三等奖二项，省卫生厅、市卫生局新技术应用奖三项。麻醉科主任李立光是省内知名专家、学科带头人。
5、生殖中心
哈尔滨市第一医院生殖中心，是省内首家开展供精人工授精和供精体外受精胚胎移植技术的生殖中心，经过国家卫健委审批及校验。拥有技术精湛、医德高尚的医疗团队和先进的医疗设备，开展辅助生殖技术、不孕症、多囊卵巢综合征、卵巢储备功能不良、男性不育、复发流产等诊疗。
