北京心外科医院排名第一的是中国医学科学院阜外医院，该院的心血管外科分为成人外科中心和小儿外科中心，成人外科中心是目前全世界最大的成人心脏外科中心之一，小儿心外科中心是国内乃至全世界最大规模的先心病诊断与治疗中心之一。此外，首都医科大学附属安贞医院心脏外科中心、北京协和医院心外科等也有较好的排名，前者是全国最早独立成科的血管外科专业科室，后者已成为北京市心外科专科住院医师培训基地。
第一名：中国医学科学院阜外医院-心血管外科
中国医学科学院阜外医院心血管外科分为成人外科中心和小儿外科中心，其成人外科中心是阜外医院外科系统最大的诊疗中心，也是目前全世界最大的成人心脏外科中心之一，是国家心脏外科博士后流动站和国家教委重点学科点，拥有心脏瓣膜及辅助循环研究室和器官移植研究室。 阜外医院小儿心外科中心是国内乃至全世界最大规模的先心病诊断与治疗中心之一，其治疗水平处于国内第一和世界领先，其治疗病种涉及所有先天性心脏病，是全国先心病诊疗的标杆，是全国领先的先心病临床研究中心，也是国际复杂先心病的先进中心。
第二名：首都医科大学附属北京安贞医院-心脏外科中心
首都医科大学附属安贞医院心脏外科中心是全国最早独立成科的血管外科专业科室，拥有南北两个病区，开放床位72张，包括监护床位20张。科室配备专业血管检查室三间、多台专门的术中数字减影血管造影机及设备先进的复合(杂交)手术室两间、全工作日血管科专科门诊，并有独立的拥有两部超声，三台多普勒超声仪，一台TCD(经颅多普勒超声)仪器的血管检查。主要治疗的动脉疾病包括胸主动脉瘤、腹主动脉瘤、主动脉夹层/夹层动脉瘤等。
第三名：北京协和医院-心外科
北京协和医院心外科的特色是诊治疑难危重病例，依托北京协和医院强大的综合实力，坚持多学科团队合作，目前心外科收治的患者中过半患者合并全身多器官/系统病变、病情危重，疑难危重患者的救治水平达到了国内领先、国际齐平水平，已成为北京市心外科专科住院医师培训基地。
第四名：中国人民解放军总医院-心血管外科
解放军总医院第六医学中心心血管病医学部成人心脏外科前身为原解放军总医院心血管外科，先后获批为解放军心血管内外科中心（1980），全军心脏外科研究所（2003），北京市重点学科（2007），国际机器人心脏外科合作与研究中心（2010年），国际达芬奇机器人外科培训基地（2012年），北京市“心血管疾病微创技术研究重点实验室”（2013年），首批国家临床重点专科军队建设项目（2014年）。
第五名：北京大学第一医院-心脏外科
北京大学第一医院心外科是医院重点发展科室之一，冠心病患者的外科治疗是该科的特色，外科技术在国内为领先水平，大血管手术，如主动脉瘤和夹层动脉瘤手术救治成功率明显提高。瓣膜病外科治疗是该科常规手术，手术疗效显著，安全性极高，尤其是联合瓣膜病的治疗成功率高。
第六名：北京大学第三医院-心脏外科
北京大学第三医院心脏外科，致力于微创冠脉外科与心力衰竭的外科治疗，为北京市乃至全国知名的心脏外科中心。该科室设备一流，实力雄厚，每年完成的手术数量居北京市前列。其中，小切口（微创）单支及多支冠状动脉搭桥手术总量居全国首位，非体外循环冠状动脉搭桥术居全国领先地位。
第七名：北京大学人民医院-心外科
北京大学人民医院心外科，已经成为国内一流的心脏外科中心，开展了各种心脏大血管手术，其中微创冠状动脉旁路移植术处于全国的领先水平，开展的非体外循环不停跳冠状动脉搭桥术等术式获得教育部科技进步一等奖。该科室是国内最早实施非体外循环冠状动脉搭桥术的单位之一，目前非体外循环搭桥的手术例数和手术难度全国领先。
第八名：北京天坛医院-心血管外科
北京天坛医院心血管外科，是国内较早开展心脏直视手术的单位之一。目前拥有一套较成熟的手术、麻醉、体外循环及术后重症监护体系和一支技术过硬的心脏外科团队。科室在国内同行中具有一定的学术地位，是首都医科大学重要的临床教学培训基地，2015年度京城好医生评选获“优秀好医生”称号，2018年度国家统战部先心病公益项目荣获十年共祝“同心大奖”。
第九名：首都医科大学附属北京同仁医院-心血管外科
首都医科大学附属北京同仁医院心血管外科，可常规开展不停跳冠脉搭桥手术、二次搭桥手术、风湿性心脏病手术治疗等，对高龄、巨大心脏等重症瓣膜病有成熟的手术及监护治疗经验。科室承担着国家863研究项目、国家自然科学基金项目、北京市科委项目等。
第十名：首都医科大学宣武医院-心脏外科
首都医科大学宣武医院心脏外科是国内成立比较早的心脏外科疾病治疗中心之一，在上个世纪80年代即已开展心脏移植等高难度手术，经过近40年的发展，目前宣武医院心脏外科已经可以开展所有心脏外科常规手术，在国内同行中具有一定的学术地位。