北京三甲医院妇科排名靠前的医院有北京协和医院、北京大学第三医院、北京大学人民医院等。其中，北京协和医院妇科是国家级重点学科，全国妇产科疑难重症诊治中心。北京大学第三医院妇科是国家教委重点学科，在部分疾病的诊治上达到了国内先进水平。北京大学人民医院妇科是国家重点学科、国家临床重点专科，对常见疾病的诊疗水平达国内领先水平。
第一名：北京协和医院-妇科
北京协和医院妇科是国家级重点学科，全国妇产科疑难重症诊治中心，国家教委博士学位授予点，妇产科博士后流动站，卫生部妇产科住院医师培训基地，国家药品监督管理局妇产科药物研究基地，国家级妇产科继续教育基地。妇产科专业分组：产科、妇科常规、妇科肿瘤、生殖内分泌、计划生育、绒癌。其擅长处理妊娠合并急危重症以及疑难内外科合并症。
第二名：北京大学第三医院-妇科
北京大学第三医院妇科，是中国大陆首例试管婴儿诞生地，是国家教委重点学科，国家妇产疾病临床医学研究中心、国家产科专业医疗质量控制中心、国家助产士规范化培训基地、全国出生缺陷防治人才培训项目培训协同单位、北京市危重孕产妇救治中心、北京市产前诊断中心、北京市示范孕妇学校、爱婴医院、母婴友好医院、国家孕产期保健特色专科医院。科室在辅助生育和妇科生殖内分泌、恶性肿瘤、围产保健和高危妊娠、围绝经期相关疾病等诊断和治疗以及计划生育方面的都达到了国内先进水平，某些方面达到了国际先进水平。
第三名：北京大学人民医院-妇科
北京大学人民医院妇科，是国家重点学科、国家临床重点专科，以妇科肿瘤、宫颈病变、盆底疾病，妇科内分泌、微创手术、超声诊断等为重点发展方向，成立了妇科肿瘤中心、盆底疾病诊疗中心，在卫生计生委临床学科评比中位居全国第二，国内有较大的影响力。能够对女性及男性不孕症进行系统规范的诊断和治疗，对输卵管阻塞，多囊卵巢综合征、子宫内膜异位症性不孕、复发性流产等常见疾病的诊疗水平达国内领先水平。
第四名：首都医科大学北京妇产医院-妇科
首都医科大学北京妇产医院妇科由著名妇产科专家林巧稚创建，是医院建院时成立的支柱科室。随着医院的发展、逐步扩大，妇科系统不断分化出妇科肿瘤、计划生育、生殖中心等亚专科，妇科定位为普通妇科。妇科系统2010年成为卫生部临床重点建设专科。几十年来，妇科在传承各种传统手术的基础上，开展以微创为前提的妇科手术治疗体系，广泛地采用腹腔镜、宫腔镜、阴道镜等妇科内镜技术。2018年成立亚洲第一个“欧洲认证的国际跨学科子宫内膜异位症中心”。
第五名：中国人民解放军总医院-妇产科医学部
中国人民解放军总医院妇产医学部涵盖妇科、产科、生殖医学科3个亚专科，6个派驻科室，现有高职专家80名。妇科在应用机器人、腹腔镜、经阴道微创手术治疗妇科良恶性肿瘤、妇科恶性肿瘤个体化治疗、妇科恶性肿瘤并发症防治、子宫内膜异位症临床和基础研究等方面均处于国内领先地位。生殖医学科目前开展人工授精、体外受精-胚胎移植（IVF-ET）、卵母细胞内单精子注射（ICSI）、植入前胚胎诊断技术等，是国家教委博士学位授予点、妇产科博士后流动站。
第六名：北京大学第一医院-妇科
北京大学第一医院妇科已发展成集医教研为一体的院内最大科室，是国家妇产科疾病研究中心(围产中心)、卫计委国家临床重点专科、教育部重点学科、世界卫生组织认定的爱婴医院和全国硕士博士培养单位及博士后流动点。妇产科目前分为妇科和产科专业，妇科包括妇科肿瘤、生殖与内分泌、感染、腔镜、女性泌尿外科以及计划生育，产科包括普通产科、母体医学和胎儿医学。
第七名：北京天坛医院-妇产科
北京天坛医院妇产科是具有鲜明特色的集医教研于一体的临床教学科室，是北京市高危孕产妇抢救指定单位。科室具有较强的临床诊疗、教学和科研实力，妇科微创手术已经成为天坛医院妇科的特点，并走在全国前列。产科的医疗水平位于全市前列。目前妇产科手术并发症率低于1％，达到国内先进水平。
第八名：中国医学科学院阜外医院-妇科
中国医学科学院阜外医院妇科创立于建院早期，在各类妇科疾病的诊治方面，具有扎实的理论基础，丰富的临床经验以及熟练地手术技巧，深受广大患者信赖。科室设备齐全，拥有彩色B超、妇科激光治疗仪等一批先进的检查治疗设备。可进行妇女保健体检、妇科炎症、宫颈疾病及宫颈癌早期筛查、月经不调、不孕不育相关诊疗。
第九名：首都医科大学附属北京同仁医院-妇产科
首都医科大学附属北京同仁医院妇产科是国内成立最早的妇产科专科之一，现已形成了专业齐全、特色鲜明的综合科室，能处理所有的妇产科疑难重症并能承担妇产科的各种大型手术。其中微创手术、腔镜手术、无痛手术和分娩、恶性肿瘤手术、外阴白斑治疗等是本科的特色。
第十名：首都医科大学宣武医院-妇科
首都医科大学宣武医院妇科技术力量雄厚，医务人员技术精湛，可规范化治疗各类急慢性妇科炎症、不孕症、月经不调、闭经等疑难病症；开展妇科恶性肿瘤、子宫切除、宫颈外阴病变切除等各式手术，盆腔脏器脱垂的各式手术，宫外孕、瘢痕妊娠手术。