乌鲁木齐神经内科比较好的医院是新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆医科大学第二附属医院，新疆维吾尔自治区人民医院是新疆规模最大的神经内科，在脑血管病的诊断治疗方面具有独特的优势。新疆医科大学第一附属医院是集医、教、研为一体的综合科室，承担着新疆地区神经内科急、危重病人的抢救任务；新疆医科大学第二附属医院的神经内科是自治区临床重点专科，静脉溶栓DNT时间最快达到20分钟，院内静脉溶栓达到10分钟，处于国内领先水平。
第一名：新疆维吾尔自治区人民医院-神经内科
新疆维吾尔自治区人民医院神经内科属于新疆自治区规模最大的神经内科，在脑血管病的诊断治疗方面具有丰富的临床经验。感染性疾病，重症肌无力，格林巴利综合症，癫痫，多发性硬化，帕金森病运动神经元病等，均是新疆维吾尔自治区人民医院神经内科主要诊治的疾病，具有多年的临床经验。神经内科对于头痛，眩晕的诊断治疗还有独特的优势。
第二名：新疆医科大学第一附属医院-神经内科
新疆医科大学第一附属医院神经内科已成立为集医、教、研为一体的综合科室。拥有动态及普通脑电图室、肌电图室、经颅多普勒室等辅助检查设备，承担着新疆地区神经内科急、危重病人的抢救任务，脑血管病，癫痫、脑变性病及神经系统遗传病等是神经内科研究重点。
第三名：新疆医科大学第二附属医院-神经内科
新疆医科大学第二附属医院神经内科，现为自治区临床重点专科，新疆医科大学重点支撑学科，新疆医科大学第二附属医院重点学科。科室收治各类脑血管病、帕金森综合征、各类头痛头晕、癫痫、痴呆、各类脑炎、脑膜炎，肌张力障碍、共济失调、肉毒中毒、中枢神经系统感染、副肿瘤综合征，及中西医结合神经康复，神经心理等神经系统疾病。静脉溶栓DNT时间最快达到20分钟，院内静脉溶栓达到10分钟，处于国内领先水平。
第四名：新疆医科大学第五附属医院-神经内科
新疆医科大学第五附属医院神经内科是自治区重点专科，开展急性缺血性卒中患者静脉溶栓、支架取栓及抽吸技术，开展脑血管造影术、颈动脉、椎动脉、锁骨下动脉起始段及颅内动脉狭窄支架植入术，开展了脑血管慢性闭塞再通技术，有效的降低了脑梗塞致残率、死亡率及复发率，脑血管病综合诊治能力全国排名百名内，全疆名列前茅。在疆内较早地成立了神经心理室，2009年开展了诱发电位P300技术，开展了记忆门诊。
第五名：新疆心脑血管病医院-神经内科
新疆心脑血管病医院神经内科拥有螺旋CT、双源CT、MR、动态脑电图、视频脑电图、经颅多普勒脑血流分析仪、大型彩超、生化放免等设备，为神经内科疾病的诊疗提供了保障。擅长开展脑缺血性疾病、中枢神经系统疾病、癫痫、眩晕症、帕金森氏病、痴呆、脑膜脑炎、多系统萎缩、周围神经病、焦虑抑郁症等疾病的诊治。针对脑血管病发病急、后遗症多、致残率高的特点，开辟了“急性缺血性脑卒中”绿色通道。
第六名：新疆医科大学第六附属医院-神经内科
新疆医科大学第六附属医院神经内科，2013年经审批为新疆首批神经内科住院医师规范化培训专科基地，自治区神经内科重点专科，国家神经系统疾病临床研究中心首都医科大学附属北京天坛医院神经系统疾病专科联盟成员单位，天坛神经介入联盟成员单位，中国帕金森联盟成员单位。熟悉神经内科常见病、多发病、疑难病的诊治，尤其对脑梗塞、脑出血、偏头痛、脑炎、脑膜炎、癫痫、痴呆、三叉神经痛、坐骨神经病等疾病有显著优势。
第七名：乌鲁木齐市友谊医院-神经内科
乌鲁木齐市友谊医院神经内科主要治疗神经系统常见病、多发病，如头痛、头晕、脑血管病变、中枢神经系统感染、癫痫、脊髓炎、周围神经病变、肌肉病变。特别是对各种急、慢性脑血管病形成了独具特点的治疗体系。神经内科积极开展神经内科介入检查及治疗，脑血管造影，动脉诊疗技术成熟，成功完成了一例颈动脉狭窄血管成形术（即颈动脉狭窄处放置支架术）。