乌鲁木齐口腔黏膜科医院排名比较靠前的是新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆维吾尔自治区中医医院。
新疆维吾尔自治区人民医院口腔科开展中西医结合黏膜病治疗，诊疗项目规范。新疆医科大学第一附属医院口腔牙周粘膜科专注口腔黏膜疾病诊疗，专科实力突出。新疆维吾尔自治区中医医院口腔科采用中西医结合诊疗模式。
1.新疆维吾尔自治区人民医院 口腔科
新疆维吾尔自治区人民医院口腔科是集医疗、教学、科研于一体的综合性口腔专科，配备先进诊疗与灭菌设备。科室开展牙周粘膜病的中西医结合治疗，承担新疆医科大学等高校临床教学及基层进修人员培训工作，发表省级以上论文30余篇，获院级科技进步成果奖8项，口腔黏膜病诊疗效果良好。
2.新疆医科大学第一附属医院 口腔牙周粘膜科
新疆医科大学第一附属医院口腔牙周粘膜科是集医疗、教学、科研为一体的专科，为全国住院医师规范化培训基地，与上海交通大学附属第九人民医院牙周科结成专科联盟。科室采用中西医结合诊疗口腔黏膜病，开展药物、局部封闭、激光辅助治疗，对复发性阿弗他溃疡、扁平苔藓、白斑等疾病诊疗水平较高，承担多项自治区级课题，发表论文30余篇。
3.新疆维吾尔自治区中医医院 口腔科
新疆维吾尔自治区中医医院口腔科是新疆口腔医学会常务理事单位、自治区口腔疾病诊疗质量控制中心成员单位，承担高校口腔专业理论教学工作。科室设有口腔粘膜病亚专业，突出各类口腔粘膜病的中西医结合治疗，人员均赴国内知名口腔院校进修，主持自治区自然科学基金等多项课题，发表论文30余篇，参编专著5部。
4.新疆医科大学第二附属医院 口腔科
新疆医科大学第二附属医院口腔科是医院重点科室，为国家级口腔全科医学规培基地，拥有自治区教育工会劳模和工匠人才创新工作室。科室设备先进，科研梯队合理，集临床、教学、科研于一体，可开展口腔常见疾病诊疗，具备规范处理口腔相关病症的能力，综合诊疗水平较强。
5.新疆医科大学第五附属医院 口腔科
新疆医科大学第五附属医院口腔科是国家口腔全科住培基地、自治区临床重点专科，为多家国内口腔专科联盟成员单位。科室包含牙周黏膜亚专业，该专业处于区内较高水平，可开展口腔黏膜相关疾病诊治，擅长复杂病例系统治疗，主持国家及自治区级多项科研项目，获自治区科技进步三等奖，学术与临床实力兼备。
