抚顺市中医院擅长的科室有儿科、骨科、普通外科、妇产科等。
1、儿科
抚顺市中医院儿科在传承发扬祖国传统医学的基础上，不断创新开拓，发展进取。秉承“团结敬业，图强奋进”为科室精神，是抚顺市中医儿科重点专科。曾获得抚顺市青年文明号，院先进集体，院优质服务科室等荣誉称号。承担辽宁中医药大学、抚顺市卫生学校多年级、多层次教学任务，接纳市内各中医院、社区医生进修。是抚顺市儿科医疗、科研、教学的重要基地。
2、骨科
抚顺市中医院骨科，是医院独具特色的著名专科。科室以中医治疗为主，中西医结合为辅，具有完备的骨伤，骨病，软伤等有代表性专业科系的辽宁省重点专科。抚顺市中医院骨科近几年开展的脊柱手术，断指（肢）再植，单、双髋关节置换术，尤其是双膝关节置换术等很多新技术填补了抚顺市空白。具有中医，中西医结合特色的夹板，外固定架，秫秸帘外固定，中药湿敷等无创伤治疗骨折方法，省内外闻名。
3、普通外科
抚顺市中医院普通外科医疗队伍实力强大，拥有独立病区，配备有最先进的美国PST自动呼吸机、脑立体定向仪等医疗设备，临床医疗业务水平处于抚顺市前列。其中胃癌、结直肠癌的规范治疗（包括胃癌、结直肠癌的术前多学科综合治疗、新辅助化疗、腹腔镜根治手术、术后辅助治疗等）等医疗技术达到国内先进水平。
4、妇产科
抚顺市中医院妇产科成立于1956年，是一个集医疗、教学、科研为一体的具有中西医结合特色的专科，年门诊量12000余人次，收治患者1000余人次。设有妇科、产科、妇产科门诊、中医综合治疗室等，擅长中西医结合治疗各种妇产科疾病，常见病及各种疑难病症及急危重症抢救治疗。