赣州市三甲医院排名靠前的有赣州市人民医院、赣南医学院第一附属医院、赣州市妇幼保健院等。赣州市人民医院是赣州市规模最大、技术力量最雄厚、服务理念最先进的现代化医院，拥有59个临床学科和医技科室，其中普外科被列为国家临床重点专科建设项目。赣南医学院第一附属医院拥有全国省会城市外第一台最新一代达芬奇手术机器人，在全国省会城市外首家开展了最新一代达芬奇机器人手术。赣州市妇幼保健院是国家级爱婴医院，在辅助生殖方面处于全市领先、省内先进水平。
第一名：赣州市人民医院
赣州市人民医院，现已形成“一院两区”格局，集医疗、教学、科研、保健、康复于一体，是江西省首批三级甲等综合医院，赣州市规模最大、技术力量最雄厚、医疗设备和管理及服务理念最先进的现代化医院。医院拥有59个临床学科和医技科室。普外科被列为国家临床重点专科建设项目，普外科、神经外科、康复科、中医康复为江西省临床重点专科，脊柱外科、神经外科为江西省医学领先学科建设学科。
第二名：赣南医学院第一附属医院
赣南医学院第一附属医院，是赣州市唯一一家省直省管三级甲等医院，江西省第三周期医院评审首批三级甲等综合医院。医院狠抓医疗质量与安全，持续提高急危重症、疑难病症诊疗水平。医院拥有全国省会城市外第一台最新一代达芬奇（Xi）手术机器人，在全国省会城市外首家开展最新一代达芬奇机器人手术。建有区域内唯一的海扶微无创治疗中心。在省内率先开展空地一体化紧急医学救援。
第三名：赣州市妇幼保健院
赣州市妇幼保健院，是一所集医疗、保健、教学、科研为一体的三级甲等妇幼保健专科医院和国家级爱婴医院，担负着全市妇幼保健业务指导、科研、教学、人才培训的任务。拥有市级医学领先学科3个：儿科、产科（围产医学）、生殖与遗传科。其中在辅助生殖方面处于全市领先、省内先进水平。
第四名：赣州市第三人民医院
赣州市第三人民医院，是集医疗、科研、教学、预防功能于一体的三级甲等专科医院，是服务该地区并辐射赣、粤、闽、湘周边地区的心理康复中心。医院普通精神科、心理与睡眠科、老年精神科为市医学重点专科。睡眠监测室为市医学重点实验室。设立在医院的章江精神病学司法鉴定所由江西省司法厅批准成立，是赣州市唯一权威的精神病学司法鉴定机构。
第五名：赣州市第五人民医院
赣州市第五人民医院，是以肝病、肺病、职业病、感染病为诊疗特色的三级甲等医院。擅长开展单孔胸腔镜下肺段切除术、肺叶切除术、支气管（肺血管）袖式肺叶切除术、全肺切除术、胸膜纤维板剥脱术、慢阻肺减容术等。精神科是医院具有特色的专科之一，以精神疾病诊疗为主体，擅长精神分裂症、双相情感障碍的治疗；对合并躯体性精神病患者的诊疗也是医院的强项，如急慢性肝炎、消化道出血等。
第六名：赣州市肿瘤医院
赣州市肿瘤医院，是赣南及周边地区唯一一所公立的集医疗、教学、科研、预防为一体的临床研究型三级甲等肿瘤专科医院。医院已形成以外科手术、放射治疗、内科治疗、介入治疗、微创治疗、免疫治疗、中西医结合治疗等为特色的肿瘤综合治疗体系。其中肿瘤放疗科、乳腺肿瘤科、胸部肿瘤外科、腹部肿瘤外科为省市共建医学领先学科，肿瘤内科、肿瘤放疗科、头颈肿瘤外科为赣州市医学领先学科。
第七名：赣州市中医院
赣州市中医院，是赣南地区唯一一家集医疗、急救、科研、教学、预防、保健、康复和养生为一体的国家三级甲等中医医院，是江西中医药大学附属赣州中医院，广东省中医院合作医院，首都医科大学附属北京中医医院技术合作医院，中国中医科学院广安门医院医联体单位。拥有骨伤科、肛肠科2个国家级重点专科，针灸科、推拿科、肾病科、脾胃病科等9个省级重点专科，
第八名：赣州市立医院
赣州市立医院，是一所集医疗、教学、科研与预防保健于一体的综合性医院，是全国唯一一所县级“三甲”综合性医院。心血管内科、心脏外科是赣州市医学领先学科建设对象，率先在全市开展了体外循环心内直视手术、冠状动脉搭桥术、全脑心血管造影术等。这些学科诊断治疗水平达到省内先进，部分研究领域已达到国内先进水平。医院其他重点科室如肾内科、烧伤科、麻醉科、泌尿外科、神经内科等都各具特色，跻身全省先进水平。
第九名：宁都县人民医院
宁都县人民医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健、康复、急救和疗养于一体的三级综合医院，医院拥有进口1.5T核磁共振仪、进口64排及16排螺旋CT等先进的医疗设备，能开展心脏和外周介入治疗；脑梗死静脉溶栓及取栓术；急性颅脑损伤治疗；高危产妇救治；超低出生体重儿、极早早产儿的综合救治；人工关节置换术；经导管颅内动脉瘤弹簧圈栓塞术及动脉瘤夹闭术等治疗。
第十名：信丰县人民医院
信丰县人民医院是一所集医疗、急救、康复、保健、教学、科研为一体的三级综合性医院。2019年度医院DRGS医疗服务绩效综合分析在全省县级医院中排名第五。经国家组织权威专家综合评定，该院达到县级医院综合服务能力推荐标准，被国家卫健委评定为“达标医院”，是全国300家、江西省8家，赣州市唯一一家达到标准的县级医院。