北京生殖科比较好的医院是北京大学第三医院、北京协和医院、北京大学人民医院等。其中，北医三院生殖医学中心是中国大陆第一例试管婴儿诞生地，是世界上技术最全面的生殖健康研究中心；北京协和医院妇产科学是全国妇产科疑难重症诊治中心；北京大学人民医院妇科成立了妇科肿瘤中心、盆底疾病诊疗中心。
第一名：北京大学第三医院-生殖医学中心
北医三院生殖医学中心是中国大陆第一例试管婴儿诞生地，是世界上诊疗规模最大、技术最全面的生殖健康研究中心。是国内首批生殖医学临床培训基地，先后诞生了我国大陆首例和第二例试管婴儿、首例赠卵试管婴儿、首例冻融胚胎试管婴儿及世界第二例、国内首例“三冻”试管婴儿等。完成“单基因检测、染色体鉴定及连锁分析”三重诊断，诞生了世界上首例MALBAC婴儿。
第二名：北京协和医院-妇产科
中国协和医科大学妇产科学系是国家级重点学科，全国妇产科疑难重症诊治中心，国家教委博士学位授予点，妇产科博士后流动站，卫生部妇产科住院医师培训基地，国家药品监督管理局妇产科药物研究基地，国家级妇产科继续教育基地。擅长处理妊娠合并急危重症以及疑难内外科合并症，建立了高危孕产妇重症监护病房（ICU）和新生儿重症监护病房（ICU），降低了孕产妇和围产儿死亡率。建立了我国第一个产前诊断实验室，研究并发展出一整套胎儿取材方法。
第三名：北京大学人民医院-妇科
北京大学人民医院妇产科分为妇科、产科、计划生育与生殖医学科3个专科。妇科学科是国家重点学科、国家临床重点专科，以妇科肿瘤、宫颈病变、盆底疾病，妇科内分泌、微创手术、超声诊断等为重点发展方向，成立了妇科肿瘤中心、盆底疾病诊疗中心，在卫生计生委临床学科评比中位居全国第二，国内有较大的影响力。为国家卫生部批准开展人类辅助生殖技术的专业医疗机构。能够对女性及男性不孕症进行系统规范的诊断和治疗，诊疗水平达国内领先水平。
第四名：中国人民解放军总医院-妇产科医学部
中国人民解放军总医院妇产医学部涵盖妇科、产科、生殖医学科3个亚专科，6个派驻科室，现有高职专家80名。妇科在应用机器人、腹腔镜、经阴道微创手术治疗妇科良恶性肿瘤、子宫内膜异位症临床和基础研究等方面均处于国内领先地位。产科在宫内转运、早产、围产保健、高危妊娠管理、危重孕产妇救治等方面形成特色优势。救治的危重症孕产妇包括：重度子痫前期、重度胎盘植入等。生殖医学科目前开展人工授精、体外受精-胚胎移植（IVF-ET）、卵母细胞内单精子注射（ICSI）等，是国家教委博士学位授予点、妇产科博士后流动站。
第五名：北京大学第一医院-生殖中心
北京大学第一医院生殖中心由郭应禄院士创建。近年来试管婴儿的成功率稳步提高，达到国内外一流水平。目前开展了体外受精-胚胎移植、卵母细胞体外成熟、宫腔内人工受精等技术。成立了国内首个多囊卵巢综合征患者多学科一日门诊，并建立了多囊卵巢综合征母儿围产预后随访平台。
第六名：首都医科大学北京妇产医院-生殖医学科
首都医科大学北京妇产医院生殖医学科是北京市首批通过原卫生部人类辅助生殖技术资质认证，准许开展常规体外受精-胚胎移植（IVF-ET）、卵胞浆内单精子显微注射技术（ICSI）及夫精人工授精（AIH）的机构。2000年生殖医学科获批北京市重点扶植学科，2006年获批北京重点建设学科。经过多年的发展，生殖医学科发展为集医、教、研为一体的生殖遗传与不孕不育诊治的专业医疗中心，为北京市生殖障碍性疾病、不孕不育患者提供生育指导、优生遗传咨询和辅助生殖技术助孕等规范化诊疗。
第七名：北京天坛医院-妇产科
北京天坛医院妇产科是具有鲜明特色的集医教研于一体的临床教学科室，是北京市高危孕产妇抢救指定单位。科室具有较强的临床诊疗、教学和科研实力，妇科微创手术已经成为天坛医院妇科的特点，并走在全国前列。产科的医疗水平位于全市前列。目前妇产科手术并发症率低于1％，达到国内先进水平。
第八名：中国医学科学院阜外医院-妇科
中国医学科学院阜外医院妇科创立于建院早期，在各类妇科疾病的诊治方面，具有扎实的理论基础，丰富的临床经验以及熟练地手术技巧，深受广大患者信赖。科室设备齐全，拥有彩色B超、妇科激光治疗仪等一批先进的检查治疗设备。可进行妇女保健体检、妇科炎症、宫颈疾病及宫颈癌早期筛查、月经不调、不孕不育相关诊疗。
第九名：首都医科大学附属北京同仁医院-妇产科
首都医科大学附属北京同仁医院妇产科是国内成立最早的妇产科专科之一，现已形成了专业齐全、特色鲜明的综合科室，能处理所有的妇产科疑难重症并能承担妇产科的各种大型手术。其中微创手术、腔镜手术、无痛手术和分娩、恶性肿瘤手术、外阴白斑治疗等是本科的特色。
第十名：首都医科大学宣武医院-妇科
首都医科大学宣武医院妇科技术力量雄厚，医务人员技术精湛，可规范化治疗各类急慢性妇科炎症、不孕症、月经不调、闭经等疑难病症；开展妇科恶性肿瘤、子宫切除、宫颈外阴病变切除等各式手术，盆腔脏器脱垂的各式手术，宫外孕、瘢痕妊娠手术。
