福州消化内科医院排名比较靠前的是福建医科大学附属第一医院、福建医科大学附属协和医院、福建省立医院。
福建医科大学附属第一医院消化内科是炎症性肠病诊疗水平国内先进，科研教学成果突出。福建医科大学附属协和医院消化科内镜微创治疗技术省内领先，危重病症抢救水平先进，是省内重要的消化系疾病诊疗与人才培养基地。福建省立医院消化内科设备先进齐全，亚专科发展完善，多学科协作诊治疑难危重病症能力强劲。
1.福建医科大学附属第一医院 消化内科
福建医科大学附属第一医院消化内科是福建省消化系统疾病医疗、教学、科研中心，拥有多项国家级、省级核心资质，包括全国首批炎症性肠病区域诊疗中心、幽门螺旋杆菌规范化诊治门诊示范中心等。科室设备先进，在炎症性肠病、胰腺疾病等领域特色鲜明，率先开展相关基础与临床研究，多学科团队服务覆盖省内外，科研成果丰硕，承担多项国家级、省级课题，获多项省部级科技奖，主编多部专著并参与全国指南编写。
2.福建医科大学附属协和医院 消化科
福建医科大学附属协和医院消化科依托福建省消化系疾病研究所，综合实力居省内领先，在消化道大出血、急性出血坏死性胰腺炎等危重病症抢救上达到先进水平。科室内镜诊疗设备先进，开展各类内镜下微创治疗，技术水平省内领先，定期举办国家级内镜培训培训班。
3.福建省立医院 消化内科
福建省立医院消化内科设备先进齐全，拥有全省最完善的消化内镜诊疗系统，内镜诊治量居省内首位。在消化内镜诊断治疗、幽门螺杆菌研究、重症胰腺炎防治等领域居省内领先，形成多个特色亚专科，联合多科室组建肝胆胰疾病诊疗中心，擅长诊治疑难危重病症。学科专家担任多项国家级、省级学术职务，发表大量论文，获20多项省级科技相关奖项，每年培养多名研究生，接收大量基层医护人员进修，学术与临床影响力广泛。
4.福建医科大学附属福州市第一总医院 消化内科
福建医科大学附属福州市第一总医院消化内科是福州市临床重点专科，挂靠福州市医学会消化病学、消化内镜学分会及消化内镜质量控制中心，是省级住院医师规范化培训基地。科室内镜中心设备先进、消毒规范，常规开展各类内镜诊疗项目，其中ERCP技术走在全省前列，难度与数量均居省内第一梯队，同时开展ESD、STER等多项高难度内镜手术。
5.中国人民解放军联勤保障部队第900医院 消化内科
中国人民解放军联勤保障部队第900医院消化内科以消化内镜诊疗、肝硬化并发症诊治、中毒救治及身心疾病诊疗为核心特长，内镜诊疗规模与水平居省内及军区一流。科室常规开展各类内镜诊断与治疗项目，对有机磷、酒精等各类中毒的抢救成功率超95%，擅长危重病症救治。
