湖北省肿瘤医院擅长的科室有乳腺科、头颈外科、肝胆胰科、放射科、胃肠外科等。
1、乳腺科
湖北省肿瘤医院乳腺科是国内成立较早、规模较大的乳腺科室之一，承担国家“两癌”之一的乳腺癌普查工作，在湖北省乳腺疾病的预防、诊断、治疗和研究中发挥主导作用。率先在全省开展乳腺癌多学科联合诊疗（MDT），并积极在全省推广，促进全省乳腺疾病诊疗水平的提升。率先在全省成功开展乳腺导管镜、微小病灶的导丝定位、麦默通微创旋切术、前哨淋巴结活检术、保乳手术、Ⅰ/Ⅱ期乳房重建手术以及腔镜手术。
2、头颈外科
湖北省肿瘤医院头颈外科是湖北省实力雄厚的头颈肿瘤专科之一，对甲状腺、下咽、喉、舌、扁桃体、唇、牙龈、颊粘膜、鼻腔、鼻窦、眼及颌面部等部位的良、恶性肿瘤的治疗具有丰富的临床经验，广泛开展了头颈部多种肿瘤的联合根治术，并对复发性肿瘤的解救和颈部包块的诊断、治疗亦有独特的方法。
3、肝胆胰科
湖北省肿瘤医院肝胆胰科，是湖北省规模较大的肝胆胰专科,科室设备齐全，技术力量雄厚，每年可收治病人2500人次。科室在尹涛主任带领下，形成了一支高水平、具有高度责任心的医疗团队，是湖北省青年文明岗之一。
4、放射科
湖北省肿瘤医院放射科是湖北省临床重点专科，现有普通放射、CT、MRI、DSA等多个临床诊疗部门，拥有国际一流的医学影像设备，可开展各项肿瘤相关诊断和介入治疗工作，在肿瘤影像规范化检查诊断、肿瘤功能学影像研究、肿瘤多学科联合诊疗（MDT）等方面独具特色，是全省乃至中部地区肿瘤疾病影像会诊中心。
5、胃肠外科
湖北省肿瘤医院胃肠外科是专业治疗胃肠道肿瘤疾病的临床专科；是湖北省重点肿瘤专科；是中国抗癌协会胃肠肿瘤培训示范基地之一，也是湖北省较早实行胃肠道肿瘤疾病微创综合治疗的单位之一；在临床医疗、教学、科研方面具有雄厚的技术力量。