武汉的三甲医院有华中科技大学同济医学院附属同济医院、华中科技大学同济医学院附属协和医院、武汉大学人民医院等。华中科技大学同济医学院附属同济医院在复旦版榜中全国第六、中南第一（连续十年全国前十）；华中科技大学同济医学院附属协和医院综合绩效考核稳居A+行列，医院入选全国首批区域医疗中心建设输出单位；武汉大学人民医院在复旦版榜中排名第40，医疗服务辐射到全国乃至海外。
第一名：华中科技大学同济医学院附属同济医院
华中科技大学同济医学院附属同济医院是一所学科门类齐全、英才名医荟萃、师资力量雄厚、医疗技术精湛、诊疗设备先进、科研实力强大、管理方法科学的现代化综合性国家卫生健康委委管医院，综合实力居国内医院前列，是国家高质量发展试点医院。2018、2019年度全国三级公立医院绩效考核全国等级A+；2020年复旦版中国医院排行榜全国第六、中南第一（连续十年全国前十）。该医院在复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》中排名第六。
第二名：华中科技大学同济医学院附属协和医院
华中科技大学同济医学院附属协和医院是国家首批三级甲等医院、全国百佳医院，荣获全国五一劳动奖状、全国文明单位等荣誉称号。医院历史悠久，实力雄厚，学科综合实力位列复旦大学医院管理研究所公布的“中国医院排行榜”全国前十；综合绩效考核稳居A+行列；医院入选全国首批区域医疗中心建设输出单位。该医院在复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》中排名第七。
第三名：武汉大学人民医院
武汉大学人民医院是湖北地区首家政府举办的公立医院、国家首批三级甲等医院，评为全国文明单位、全国精神文明建设先进单位、全国五一劳动奖状集体等。2020年在中国医院影响力综合排行榜中位居全国第11名，2020年中国科技量值位居全国前20、科技产出排名全国医院第3名。医疗服务辐射到全国乃至海外，2021年医院门诊量580万，位居全国第8。该医院在复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》中排名第40。
第四名：武汉大学中南医院
武汉大学中南医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家首批三级甲等医院、全国百佳医院、爱婴医院，荣获全国文明单位、全国卫生系统先进集体等荣誉称号。在2018-2022年度全国三级公立医院绩效考核国家监测指标结果中，医院等级稳居A+行列；在复旦大学医院管理研究所发布的《2021年度中国医院排行榜》中，医院综合排名全国第55。
第五名：武汉大学口腔医院
武汉大学口腔医院现已发展成为一所集教学、科研、医疗于一体的高等口腔医学院校，是我国重要的口腔医学院和主要的口腔医学教育基地之一。医院是三级甲等专科医院，也是口腔医学专业教学、科研和临床实习的基地，拥有国家临床重点专科，能够为武汉市、中部地区乃至全国的患者提供全面而精良的口腔医疗与保健服务。该医院在复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》中排名第96。
第六名：武汉儿童医院
武汉儿童医院是首批通过三级甲等医院评审的儿童专科医院，拥有1个国家级重点专科、17个省级重点专科和28个市级重点专科，现已发展成为专科设置齐全、技术力量雄厚、医疗质量优质、服务水平优良的大型综合性妇女儿童专科医院，影响力不断提升。先后荣获“全国文明单位”、“全国百佳医院”、“爱婴医院”、“全国青年文明号”等荣誉。
第七名：武汉市第一医院
武汉市第一医院是一所集医疗、教学、科研为一体的现代化综合性三级甲等医院，是全国首批重点中西医结合医院，拥有国家临床重点专科4个，省级重点专科41个，先后荣获全国抗击新冠肺炎疫情先进集体，省、市先进基层党组织，省、市五一劳动奖状，省、市文明单位等多项荣誉表彰。
第八名：武汉市第三医院
武汉市第三医院是集医疗、科研、教学、防保于一体的大型综合性三级甲等医院，医院专业学科门类齐全，现有国家临床重点专科1个，湖北省重点专科20个，武汉市重点专科37个。在复旦大学医院管理研究所华中区医院综合实力排行榜中，名次逐年提升，排名稳居前二十以内；在“中国最佳专科声誉排行榜”中，烧伤科连续多年排名全国前十，荣获“华中地区医院专科声誉排行榜”第一名。
第九名：武汉市金银潭医院
武汉市金银潭医院是集医疗、教学、科研、预防为一体的公共卫生医疗救治基地，主要承担湖北省和武汉市传染病及重大疫情的防控任务并开展综合医疗服务。在2021年度中国医学院校/中国医院科技量值（STEM）中，结核病学（10名）在中国医院排名中跻身前十；传染病学（25名）、呼吸病学（40名）、胸外科学（49名）名列榜单前五十名，均创历史最高水平。在五年总科技量值排名中，结核病学全国第十一，位居湖北榜首。
第十名：湖北省肿瘤医院
湖北省肿瘤医院是湖北省卫生健康委直属的集预防、医疗、康复、科研、教学于一体的大型三级甲等肿瘤专科医院，医院瞄准国际、国内肿瘤医学最新发展，积极研究和应用当代先进的医疗技术手段和方法，采用国际先进的MDT治疗理念，坚持系统、规范、综合治疗的原则，走多学科结合、中西医结合等治疗肿瘤的道路，逐步形成了各学科在省内外的明显优势，综合治疗水平均位居全国前列。