肺栓塞建议就诊于呼吸科，上海治疗肺栓塞疾病医院排名靠前的是上海交通大学医学院附属瑞金医院呼吸科、复旦大学附属中山医院呼吸科、复旦大学附属华山医院呼吸科等。上海交通大学医学院附属瑞金医院呼吸科2021-2023年全国专科声誉、综合排名均位列第5，是国家临床重点专科，呼吸系统疾病诊疗实力处于国内第一梯队。复旦大学附属中山医院呼吸科多年稳居全国专科排名前6，是首批国家临床重点专科建设单位，呼吸危重症救治技术处于国内领先水平。复旦大学附属华山医院呼吸科是国家标准化肺血管中心（示范单位），也是上海市医学会呼吸病学专科分会肺血管病学组组长单位，肺血管病诊疗特色十分突出。
1、上海交通大学医学院附属瑞金医院 呼吸科
该科室2021-2023年全国专科声誉排名、综合排名均位列第5，是国家临床重点专科、国家教育部重点学科，连续10年获评先进集体，2010年获上海市呼吸内科质控检查第1名，是国内较早开展硬质气管镜、纤维支气管镜检查及呼吸重症监护室建设的单位之一，目前可开展EBUS、内科胸腔镜等前沿技术，可诊治肺栓塞、慢性气道疾病、睡眠呼吸障碍、肺部感染、胸膜疾病等多类呼吸系统疾病，依托成熟的呼吸重症救治体系，可为肺栓塞合并呼吸衰竭等危重症患者提供强有力的救治支撑。
2、复旦大学附属中山医院 呼吸科
该科室2023年全国专科声誉排名第6，2021、2022年全国专科综合排名均位列前6，是首批国家临床重点专科建设项目单位，建有上海市呼吸病研究所、上海市肺部炎症与损伤重点实验室等多个科研平台，下设呼吸危重症、慢性气道疾病、肺部肿瘤与介入等五大亚专科，可诊治肺栓塞、重症肺炎、慢阻肺、肺癌、间质性肺病等多种呼吸系统疾病，依托呼吸危重症亚专科的ECMO、血液净化等体外生命支持技术，能为高危肺栓塞合并循环呼吸衰竭的患者提供全方位救治保障。
3、复旦大学附属华山医院 呼吸科
该科室是国家标准化肺血管中心（示范单位）、上海市医学会呼吸病学专科分会肺血管病学组组长单位，也是国家PCCM规范化培训优秀基地，拥有肺血管病诊疗与介入、呼吸危重症、呼吸介入等多个成熟亚专科，可开展肺栓塞、肺动脉高压、支气管哮喘、肺癌、间质性肺病、睡眠呼吸障碍等多类疾病诊治，针对肺栓塞已建立多学科诊疗模式与急性肺栓塞诊治绿色通道，可开展肺栓塞溶栓/碎栓/取栓术等介入技术，诊疗能力处于国内先进水平。
4、上海交通大学医学院附属仁济医院 呼吸科
该科室是上海交通大学医学院博士授予权学科、上海市呼吸专科培训基地，也是上海市医学会间质性肺病学组组长单位，设有肺功能室、气管镜室等功能单元，可诊治肺栓塞、肺癌、间质性肺病、支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病、肺部感染、胸膜疾病等多类呼吸系统疾病，常规开展经支气管镜肺活检、经皮肺穿刺、胸膜固定术等诊疗技术，依托完善的内科诊疗体系，可为肺栓塞患者提供规范的病情评估与个体化治疗方案。
5、上海交通大学医学院附属第九人民医院 呼吸内科
该科室是上海交通大学医学院呼吸疾病研究所和上海交通大学慢性气道疾病诊治中心组成单位，2023年度STEM排名位列全国第54位，是上海市专科医师规范化培训（呼吸与危重症医学）基地，重点发展经呼吸内镜和经皮呼吸介入技术，可诊治肺栓塞、慢性气道疾病、肺部肿瘤、肺部感染、胸膜疾病等多类呼吸系统疾病，依托完善的呼吸介入与重症诊疗体系，可为肺栓塞患者提供病情评估、并发症处理及合并症管理等全流程诊疗服务。
