首都医科大学附属北京安定医院擅长的科室有临床心理科、儿童精神科、老年精神科、中医科、精神科等。
1、临床心理科
首都医科大学附属北京安定医院临床心理科提供先进的心理诊断与心理治疗技术，为心理疾病患者和有心理困惑者提供专业的心理咨询、心理治疗和药物治疗的综合医学服务。临床心理科目前开设三个门诊：焦虑障碍门诊、心理咨询门诊；一个心理测查中心，一个临床心理研究室。
2、儿童精神科
首都医科大学附属北京安定医院儿童精神科是目前国内规模最大、专业设置最齐全的儿童精神科高级医学人才培养平台，也是全国最大的儿童精神疾病的诊疗、研究中心之一。在国内率先建立和推广以药物治疗、心理治疗、工娱治疗、康复训练、健全人格培养为核心的综合治疗模式和治疗-康复-预防为一体的连续式服务机制。
3、老年精神科
首都医科大学附属北京安定医院老年精神科是国内最早从事专业老年精神卫生诊疗的机构。集临床、教学、科研、预防为一体的综合性老年精神科服务平台，病区还承担着首都医科大学及各大院校老年精神障碍的理论授课和临床带教工作。主要收治晚发精神分裂症、老年期情感障碍、老年期焦虑、睡眠障碍、轻度认知功能损害等疾病患者。
4、中医科
首都医科大学附属北京安定医院中医科擅长运用中医药治疗精神科药物所致的各种副反应包括锥体外系副反应、迟发性运动障碍、药源性闭经及性功能障碍等，并能运用中药开展戒毒治疗。
5、精神科
首都医科大学附属北京安定医院精神科复旦专科排行榜排名第5，作为北京脑重大疾病研究院精神分裂症研究所的依托科室，主要开展精神病性障碍的诊断、个体化药物治疗以及早期干预。