新疆小儿精神科医院排名靠前的是新疆维吾尔自治区人民医院临床心理科、新疆医科大学第一附属医院心理医学科、新疆医科大学第二附属医院临床心理科等。新疆维吾尔自治区人民医院临床心理科是自治区级精神科临床重点学科，诊疗范围覆盖儿童期情绪障碍和行为障碍，年门诊量约45000人次；新疆医科大学第一附属医院心理医学科设有专门的儿童与青少年精神病学亚专业，是全疆综合医院中亚专业设置最齐全的心理医学科室；新疆医科大学第二附属医院临床心理科可开展青少年心理问题、学习障碍的规范化诊疗，实行开放式住院模式减轻患儿心理负担。
1、新疆维吾尔自治区人民医院 临床心理科
该科室创建于2007年，集临床、科研、教学为一体，设有心理评估室、沙盘治疗室、经颅磁刺激治疗室等多个功能单元，是国家级精神科住院医师规范化培训基地、自治区级精神科临床重点学科、国家精神心理疾病临床医学研究中心新疆分中心，诊疗范围涵盖儿童期情绪障碍和行为障碍等多类精神心理疾病，年门诊量约45000人，年会诊量约12000次，患者满意率大于95%。科研层面承担国家自然科学基金项目2项，发表核心期刊论文200余篇，参编专著15本。
2、新疆医科大学第一附属医院 心理医学科
该科室前身是1992年成立的心身科，是全疆综合医院中拥有病床数最多、亚专业设置最齐全、专业技术力量最强的心理医学科室，为医院重点建设科室。科室设有儿童与青少年精神病学亚专业，诊疗范围覆盖儿童和青少年精神障碍等十大类七十个小类近四百种精神心理问题，年门诊量超10000人次，年收治病人超1200人次。科室是新疆医科大学精神病与精神卫生学硕士学位点、新疆精神科专科医师培训基地，已培养多名硕士研究生，科研方面发表学术论文数百篇，承担多项国家级、自治区级科研课题，总经费达数百万元。
3、新疆医科大学第二附属医院 临床心理科
该科室成立于2017年，是医院发展迅速的年轻临床科室，在全疆三级甲等综合性医院中，医疗质量、门诊和住院人数均名列前茅。科室现有在职医师2名，均具备扎实的内科学基础和心理学专业知识，实行开放式住院治疗，摒弃传统铁门铁窗模式，充分减轻儿童青少年患者的住院心理负担，人性化服务特点突出。科室诊疗范围覆盖青少年心理问题、学习障碍、抑郁症、焦虑症、睡眠障碍等多种精神心理疾病，重点发展急重症、疑难复杂精神卫生疾病诊断技术，坚持标准化诊断、规范化治疗，受到广大患者及家属的好评。
4、中国人民解放军新疆军区总医院 心理咨询科
该科室由一批临床经验丰富的主治医师以上职称的医务人员组成，具备系统的精神心理诊疗功底。科室熟悉心理咨询科常见病、多发病的诊治，尤其在学生心理问题、失眠、双相情感障碍、网瘾、进食障碍、产后抑郁、物质依赖、神经性呕吐等方向的诊疗上具有显著优势，可覆盖儿童青少年期常见的情绪、行为及成瘾类精神心理问题的干预与诊疗。科室依托军队医院的诊疗资源优势，坚持规范诊疗原则，为全疆各族患者提供专业的精神心理健康服务。
5、石河子大学第一附属医院 临床心理科
该科室始建于1986年，前身为神经内科下属的医学心理研究室，2023年独立成科，集临床、教学、科研为一体，开放床位50张，设有沙盘治疗室、个体/团体心理治疗室等多个功能单元，诊疗范围包含儿童心理与行为障碍、儿童注意缺陷多动障碍、抽动障碍等小儿精神科常见疾病，年门诊量28935人，年出院患者815人。科研层面立项课题30余项，发表论文150余篇，获省部级科技进步奖7项。
