阜阳胃肠外科医院排名靠前的是安徽医科大学附属阜阳医院普外科、阜阳市人民医院普外科、阜阳市第五人民医院外科等，安徽医科大学附属阜阳医院普外科是安徽省临床重点专科，常规开展胃癌、结直肠癌根治术及腹腔镜微创胃肠肿瘤手术；阜阳市人民医院普外科是皖北地区普外临床医疗、教学、科研中心，年手术量5000余台，常规开展腹腔镜下胃肠道肿瘤根治术；阜阳市第五人民医院外科设有胃肠外科亚专科，常规开展腹腔镜下及开腹胃癌根治、结直肠癌根治术。
1、安徽医科大学附属阜阳医院 普外科
该科室是安徽省临床重点专科，为皖西北地区第一家省级普外科临床重点专科，也是安徽省胃肠外科专科医疗联合体成员单位。科室设有胃肠疝减重、肛肠外科专业组，除常规开展胃癌根治、结肠癌根治、直肠癌根治等手术外，腹腔镜结直肠癌根治手术也已开展，未来将逐步开展腹腔镜下保留直肠上动脉的上段直肠癌根治、乙状结肠癌根治以及腹腔镜胃癌根治等手术。此外，科室还开展腹腔阑尾切除术、小儿肠套叠复位术等胃肠相关手术，并配备超高清腹腔镜、CT三维重建等先进设备，可开展腹膜后肿瘤切除等复杂手术。
2、阜阳市人民医院 普外科
该科室成立于1949年，是皖北地区普通外科学临床医疗、教学、科研工作中心，也是阜阳市临床医学普外科重点学科。科室分为胃肠、肝胆胰、甲乳、血管、肛肠五个病区，设有胃肠专家门诊，年手术量5000余台，年出入院病人8000余人。科室常规开展腹腔镜下胃肠道肿瘤根治术、胃癌根治、结直肠癌根治术等胃肠外科核心手术，并建立健全急重症病人救治机制，对急性重症胰腺炎、复杂肠瘘等胃肠急重症诊治具有丰富经验。科室依托陈孝平院士工作站，与全国多家著名医院建立远程会诊机制，协助处理复杂疑难胃肠病例。
3、阜阳市第五人民医院 外科
该科室成立于上世纪50年代，已逐步划分建设亚专科，设有独立的胃肠外科亚专科。科室胃肠外科常规开展腹腔镜下及开腹胃癌根治+D2淋巴结清扫术、结直肠癌根治术，根据国际、国内诊疗指南，术前、术后均有胃肠肿瘤外科、化疗、影像、病理等多学科专家同时对每一位胃肠肿瘤患者资料进行分析讨论，共同制定治疗方案。科室还常规开展腹腔镜下急诊手术，如腹腔镜胃肠穿孔修补术、阑尾切除术、肠梗阻等，并配备进口电子腹腔镜手术系统、超声刀等先进设备，与中科大第一附属医院（安徽省立医院）有长期学术交流。
4、阜阳市中医医院 外科
该科室由普外科和泌尿外科组成，成立于1986年，以微创手术技术为特色，中医药参与围手术期治疗，对术后康复起到明显加速效果。科室常规开展腹腔镜下胃肠道肿瘤根治性切除术、阑尾切除术等胃肠相关手术，并选择性开展日间手术模式。科室拥有进口腹腔镜成像系统、强生超声刀系统等高精尖设备，坚持"精准、微创、加速康复"的发展理念，将中医药特色融入胃肠外科围手术期管理，为胃肠疾病患者提供中西医结合的综合诊疗方案。
5、太和县中医院 普外科
该科室是医院较早创建的科室之一，集肝胆、胃肠、血管、疝与腹壁外科等专业组于一体，是阜阳市重点培育专科。科室胃肠外科可常规开展腹腔镜胃癌根治术、腹腔镜结直肠癌根治术，以及腹腔镜下阑尾切除、腹腔镜下胃穿孔修补术等胃肠微创手术。作为中医综合医院，科室在胃肠外科诊疗中突出中西医优势，针对急性胰腺炎、肠梗阻、阑尾周围脓肿等胃肠外科疾病，可根据疾病发展规律加入传统中医方案治疗，为胃肠疑难病例提供不同思路的治疗方案，并配备德国STORZ高清腹腔镜、强生超声刀等先进设备。
